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玉米粗缩病7号色体抗病位点的精细定位.pdf
山东大学硕士论文
玉米粗缩病7号染色体抗病位点的精细定位
中文摘要
玉米(Zea L.)是世界上重要的粮食兼饲料作物,在国民经济中占有非
mays
Dwarf
常重要的地位。玉米粗缩病(MaizeRough Disease,MRDD)是一种广泛分
布的病毒性病害,近年来在我国蔓延流行,造成了很大的危害,严重影响了玉米
产量。充分利用已有的抗性资源,定位和克隆粗缩病抗性基因,深入研究抗病机
制是从根本上解决病害问题的有效途径。
本实验室王飞利用掖478×90110的后代将玉米粗缩病的三个抗病位点定位
间的距离为5.8cM。
根据(掖478×90110)F2群体中玉米粗缩病抗病位点的定位结果,本工作选
用了来自抗病自交系90110和感病自交系掖478杂交后代的重组自交系F038141
在6号染色体位点均表现为感病基因型,用连锁标记umel656检测时,电泳条
带与掖478一致;在8号染色体位点均表现为抗性基因型,用连锁标记bnl91823
和umcl268检测时,电泳条带与90110一致;两者在7号染色体上的位点存在
差异,前者表现为感病基因型,后者表现为抗病基因型。
10和掖478间以及F2群体中表现出多态性的标记,其
SSR弓I物47对,筛选可在901
中13个SSR标记产生清晰的差异带,用于对定位群体进行SSR作图分析,最终将
的范围内,与umcl401和L6的遗传距离均为0.7cM。为了确定结果的可靠性,同
时构建了90110与掖478的F2群体在此区域的局部分子标记连锁图。
山东大学硕士论文
DNA进行扩增,经过筛选发现在亲本间存在多态性的引物有257个,在亲本间
没有多态性的引物有148个,无扩增产物和扩增条带极弱的有19个,多态率为
58%。其中引物$217扩增的条带在两个亲本问存在多态性,并且此多态性与抗
感、池的扩增结果相一致,差异带在340bp左右。测序结果表明这个片段全长
分序列及其随后的3’端序列匹配。该预测基因全长215lbp,由四个外显子和三
个内含子组成,编码蛋白属于半胱氨酸蛋白酶抑制因子家族,编码蛋白全长
184aa。
domain程序找到
利用生物信息学数据库maizesequence和NCBI的conserved
了4个存在于定位区间umcl401和L6之内的可能性比较大的候选基因。其中
GRMZM2G13
1926含有两个抗病基因保守结构域丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶和亮氨
基因的结构特征,这几个基因值得重点研究。
另外,本工作研究了三重SSR引物反应体系,找到了一个适用于同时可进
行三个玉米粗缩病抗病位点检测的反应体系,可应用于今后的分子标记辅助选
择育种。
本工作对玉米粗缩病7号染色体抗病位点进行了精细定位,筛选出部分候选
基因,并研究了三重SSR引物反应体系,为今后的玉米粗缩病抗病基因克隆和
分子标记辅助育种打下初步的基础。
关键词:玉米、玉米粗缩病、分子标记、基因定位
2
山东大学硕士论文
of locus chromosome7
Fine the on
mapping conferring
resistancetomaize(Zea dwarfdisease
maysL.)rough
ABSTRACT
an fbodandfodder inthe
Maize(ZeamaysL.)is important crop world,
a crucial inthenation
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