瓜伊马斯热液口培养Thermococcales的多样性研究及Pyrococcus yayanossiCH1的基因组分析.pdfVIP

摘要 CHl的基因组分析 Pyrococcusyayanossi 摘要 应能力强，往往成为环境中的主导微生物类群。这类微生物可将单质硫还原为 H2S，因而在诸多海洋高温生态系统的碳、硫循环中扮演重要的角色。瓜伊马斯 海盆位于东太平洋洋中脊上，热液活动频繁。由于上层水域生产力高，大量浮游 生物碎屑沉积至海底，在高温热液的作用下热解成类似于石油一样的化合物。瓜 缘菌株间16SrDNA序列高度相似，无法对不同菌株进行区分，本研究通过比较 Elongation 代替16SrDNA的一个基因标记。 CHl 上唯一一株严格嗜压的超嗜热古菌。由于其最适生长压力大于原始分离环境的水 压，因此推测CHl生活于海底以下3km左右的高温岩层中。CHl基因组全长 CHl偏好于利用第三位碱基为G或C的密码子。在蛋白的氨基酸组成方面，CHl 偏好于多利用甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、组氨酸、精氨酸，少利用异亮氨酸、赖 T 摘要 在基因排列顺序方面有很大不同，但这一现象并不是插入序列及转座酶所引起的 基因重排所导致。数量较少的插入序列及转座酶使CHl在最大程度上保留了原 间存在基因交流的直接证据。微生物间的基因交流使得优势基因在不同微生物间 进行传递而最终得以保存。这种机制可能有利于微生物群落应对热液口剧烈变化 的环境。COG基因功能分析结果显示，CHl代谢碳氢化合物及氨基酸的能力较 弱。与此相反的是，CHl拥有较多的氢化酶和膜结合复合体，说明CHl拥有更 强的呼吸能力，更偏好于利用呼吸产能。在洋壳深部的高温岩层中，地质过程可 因组中保留了甲酸裂解复合体及较多的氢化酶，这些证据说明CHl来自于深部 生物圈，而热液的喷发将其带到海底火山口。 关键词：热球菌目；热球菌；火球菌；基因组；瓜伊马斯热液口 II Abstract ofCulturableThermococcalesin Diversity Guaymas VentsandtheGenome of Hydrothermal AnalysisPyrococcus Abstract TheorderThermococcalesa of represents largegroup anaerobes．Itconsistsofthree organoheterotrophic are distributedinvariousmarine 砂加COCCUS，Palaeococcus．Theywidely high solfataricenvironments．Theirfast characterand to ability temperature growing strong makethemasoneofthedominantmicrobialinvariousenvironments． adapt groups Asa