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甘蓝型油菜A7千粒重主效QTL的精细定位.pdf
甘蓝型油菜A7一千粒重主效QTL的精细定位
摘 要
本课题组借助分子标记和QTL作图等生物学技术在9个环境中利用282个
DH群体对甘蓝型油菜的19对染色体进行了千粒重的初定位,其中有7个环境
都一致地在第7号染色体(A7)上相同的区域检测到一个效应值较大的QTL,
的初定位结果,为后续的精细定位和图位克隆打下了良好的基础。
本研究在此基础上进行,通过对A7.目标QTL区间标记辅助选育,发展含
1
测定。并借助白菜基因组第7连锁群的序列信息以及与拟南芥基因序列进行同源
比对针对A7.千粒重QTL区间发展位置特异性标记。从而对A7.千粒重QTL进
行确认和精细定位,主要结果如下:
1.A7.目标QTL区间标记加密
根据甘蓝型油菜A7.千粒重QTL的初定位结果,借助白菜A7连锁群基因组
序列信息针对甘蓝型油菜A7.千粒重主效QTL区域发展了位置特异性标记上百
个,其中定位上了“个。标记从原来的19个增加到现在的63个,并使其标记
间平均距离由2.12cM减小到0.60cM。
2.A7.目标QTL的确认
利用1
对甘蓝型油菜A7.千粒重QTL进行确认和缩小区间。通过关联分析以及近等替
换系间的比对分析,发现在A7.千粒重QTL区间内大粒和小粒等位基因间确实
存在显著的差异(卢O.001),其均值差为0.1909:QTL区间由初定位的40.3cM
l
摘 要
缩小到9.0cM,位于ESPSC2和乙~AS864之间。
3.A7.目标QTL的精细定位
QTL进行精细定位。通过BC4F1世代单株基因型和BC如株系表型的关联分析
以及其近等基因系间的比对分析之后,将A7.千粒重QTL区间进一步缩小到了
纯合大粒等位基因(SolluX)片段的株系对千粒重的贡献相对于含纯合小粒等位
前这个QTL区间的遗传距离还比较大,所以需要进一步加密区间标记以及培育
更高世代的回交群体,才能进一步地缩小目标区间的遗传距离。
小粒等位基因被欧洲品种“Sollll)【”中控制大粒等位基因纯合替代时,可显著提
高千粒重约O.23lg,所以有必要对A7.目标区间作更进一步的精细定位和图位克
隆控制该OTL的关键基因。
关键词:甘蓝型油菜;近等基因系;精细定位:千粒重
n
FINGNL气PPINGOFAN队JORFOR1OOO—SEED
QTL
Ⅵ但IGHToNLD姒GEGROUP Z}冗4.S:S,C4
7(A7)IN
NAPUs
ABSTRACT
B舔ed0n廿leiIlitial Ooo·seed SG-DH
QTLmapp恤g蠡泔1 weightusing population
(282 locatedon
lines)oV贸9锄V的nm∞ts,0nem旬0rQTL 1i1血age掣oup7(A7)w嬲
selected
for缸cllcr缸e deteCtedin7 of9
map曲g.ⅢsQTLw觞s讪1y
锄V的nmentS谢mLODValue的m3.35t0l6.75锄d ph吼otypic
eXplaincd也e
Vad撕onin 4.90%t0l7.90%.111is additive
populati∞舶m QTLShowed弛aVerage
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