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甘薯抗茎线虫病本的聚类分析.pdf
甘薯(Iponoeabatatas(L口m))是一种重要的粮食、饲料、工业原料及新型能源
用块根作物,广泛种植予全球100多个国家,在世界粮食生产中总产列第七位【¨。
我国是世界上最大的甘薯生产国。
白1937年以来,甘薯茎线虫病从日本传入我国,我国的甘薯产量受到茎线
虫的严重危害,一般的发病田块减产20%一50%,重病田块甚至绝产无收。目前
解决甘薯茎线虫病的根本方式是将常规育种和分子育种相结合。传统育种在甘薯
抗病育种中受到一定的限N-甘薯遗传背景十分复杂;杂交育种时经常表现为自
交不亲和性等多重障碍,导致难以获得F1代种子;培育时间太长等缺点。分子
育种作为常规育种的辅助手段,包括抗病基因(候选基因)的克隆、分子标记的
筛选等。以DNA多态性为基础的分子标记,是DNA水平上的遗传多态性的直
接反映,是一种新的遗传标记,可以辅助甘薯抗病育种,进行甘薯的抗病遗传多
样性分析,加快抗病育种的步伐。
本研究以高抗甘薯茎线虫病品种徐781和高感茎线虫病品种徐18及实验室
保存的50种甘薯材料为亲本材料,通过SRAP、SSR及RGA分子标记方法筛选
引物,以期在实验材料中获得甘薯材料间的亲缘关系,为甘薯的亲本选配和后续
育种研究奠定了一定的基础。通过实验所得的主要结论如下:
一、SRAP.RGA实验结果:
1、SRAP—RGA扩增产物的多态性分析结果
11对带型清晰、多态性较好的引物组合对50份供试甘薯材料进行扩增,所扩
带137条,其中多态性条带为121条,占总带数的88.32%。不同的引物对产生的多
态率明显不同。最高是EM4.S2.A07.F引物对的多态率为100%,最低是
·EM8.S1.F03.F引物对的多态率为63.6%。
2、SRAP.RGA扩增产物聚类分析结果
应用UPGMA法对50个品种进行聚类分析,结果如下:在相似系数为0.51时,
将50个品种划分为3大类群。第一类包括30个品种:南薯88、皖702、川山紫、二
甘薯抗茎线虫病亲本的聚类分析
号、徐18。
3、SRAP.RGA扩增产物遗传多样性分析结果 。
根据多态性条带统计结果,采用NTSYS软件计算出甘薯种质问的相似系数,
性系数最小,为0.1818,说明他们之间的遗传距离较远,而199029.1(3)和南薯
离较近。
二、SSR实验结果:
以徐18和徐781为亲本材料,经SSR反应体系PCR扩增后,用聚丙烯酰
胺凝胶电泳检测,总72对引物中筛选出21对多态性引物,分别是第4对、第
第49对、第50对、第52对、第60对。
关键词:甘薯、SRAP、SSR、RGA、聚类分析
II
Abstract
Abstract
akindof raw
food,feed,industrial
Sweetpotato(Iponoeabatatas∞口聊.))isimportant
materialandnew root ithasbeen cultivatedinover
energycrops.Nowadayswidely
100countriesallovertheworld.Itsoverall ranksseventhinallthefood
production
isthe of intheworld.
production.Ourcountrylargestproducersweetpotato
The stemnematodediseasehasbeen from toChina
sweetpotato passed Japan
si
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