拟南芥突变体网分析平台开发.pdfVIP

摘要 摘要 在模式植物拟南芥功能基因组学研究中，为了更好的鉴定基因功能，基于阻断或增 加基因表达技术的火量突变株系被构建。目前分布在各个研究机构的数十万株系几乎饱 和的覆盖了整个拟南芥基因组，其中包含大量宝贵的明显表型突变体。这些突变体资源 对于其他植物学研究工作者来说，具有巨大的利用价值，然而目前这些数据资源往往都 散布在种子资源数据库和文献资源中，没有统一的检索标准和展示模式，很难被有效的 查询利用。本研究通过对已有突变体数据资源中明显表型突变体的收集整合，结合已有 植物形态学等分类方法，基于统一标准注释分类这些突变体资源，在此基础上利用基因 表达谱、蛋白质质谱、蛋白相互作用，基因转录调控等其他功能基因组学研究数据对收 集的数据资源进行相应的注释分析，最后通过网络应用程序将数据资源、分析结果、分 析工具整合为网络分析平台便于生物学家的检索和应用。 关键词拟南芥；突变体；数据库；表型 Abstract ADStraCt Inthe model functional of plantArabidopsis’S genomicsresearch．analysisgenetic mutatiotaisone ofthe·aosteffectiveto gene waysinvestigate numbersofmutantlineshavebeen bv generated mutantinformationhas been andreleasedinStock techniques．Inparallel．phenotypic acquired databasesorthe filesof kindsof ofthese supplementaryalreadypublishedpapers．An informationare invaluableresource．butnouniform criteriaor modeis query display in formulated thesedatainastandardization integrating way。Byintegratingexistingresoule圮s， themutantshavevisible which alterationsin werecollectedandclassifiedbaseon phenotype unifiedstandards．Gene mass expressionprofiledata,proteinspectrometrydata，protein． interaction network dataandotherfunctional regulation