两种爬行动物MHCⅡ类B基因第二外显子序列研究及跨种多态性的分析.pdfVIP

两种爬行动物 MHC Ⅱ类B 基因第二外显子序列分析 及其跨种多态性研究 摘 要 主要组织相容性复合体（MHC ）是由紧密连锁的高度多态的基因位点 所组成的染色体上的一个遗传区域，其编码的产物负责识别呈递外来抗 原，因此在脊椎动物的免疫系统中发挥着重要作用。多态性是 MHC 基因 的重要特征，它反映生物对寄生虫和病原体的抵抗力，从而影响种群的长 期生存，因此 MHC 基因的遗传变异分析广泛应用于保护遗传学。目前， 基于 MHC 基因的研究主要集中在Ⅱ类基因，特别是这类基因的第二外显 子。 为了研究爬行动物的 MHC 基因，本文设计了一对兼并性引物扩增乌 龟（Chinemys reevesii）和中国石龙子（Eumeces chinensis ）MHC Ⅱ类B 基 因第二外显子的部分片段，并对其进行克隆及序列分析，旨在初步了解两 种爬行动物 MHC 基因的序列结构和变异特征，为其种群遗传结构研究作 前期工作。结果从乌龟和中国石龙子中分别获得8 个和7 个长度均为 166pb 的不同序列，通过序列比对发现序列的多态性较高，核苷酸的非同义替换 （d ）明显多于同义替换（d ），说明平衡选择可能发挥着作用，由此造成 N S 的氨基酸的替换趋于集中在抗原结合位点（pABS ）附近；同一个体中出现 多个序列，提示可能存在着座位重复。同时研究发现爬行动物MHC Ⅱ类B 基因存在着跨种多态性现象，这在爬行动物中尚属首次，有助于 MHC 基 因跨种进化研究，具一定的理论意义。 关键词：乌龟；中国石龙子；MHC Ⅱ类B 基因第二外显子；序列分析； 跨种多态性 Sequences Analysis of the Second Exon of MHC Class Ⅱ B Gene and Trans-species Polymorphism of Two Reptiles Abstract The major histocompatibility complex (MHC) is a chromosomal region consisting of closely linked loci which are highly polymorphic. Genes of the MHC encode molecules responsible for the recognition and presentation of foreign antigens and thus play an important role in immune system in the vertebrates. The polymorphism is the essential characteristic of MHC genes and variability of MHC genes is an indicator for the parasite and pathogen resistance, which in turn may influence the long-term survival probability of populations, so the genetic variation of MHC is widely applied to conservation genetics. At the present time, studies based on MHC genes are mainly focused on Class Ⅱ gene, especially the second exon of Class Ⅱ. In order to study MHC genes of reptile, we investigated genetic variation at exon 2 (including part of the puta