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Beilstein使用指南
Beilstein 使用培训(一) ----化学合成反应的检索 CrossFire Commander 7.0 使用界面 CrossFire Structure Editor 功能键的介绍 原子或官能团通式的缩写 使用CrossFire自带的模板画结构 定义反应物和产物 定义反应中心及手性翻转情况 结构大小及字体的调整 检索主页面 定义可能具有互变异构体的结构 定义两个取代基的杂环 定义两个取代基的杂环 定义环状和非环状结构 定义环状和非环状结构 定义环状和非环状结构 定义检索结构 定义检索结构 对反应检索结果进行限定 对反应检索结果进行限定 对反应检索结果进行限定 通过相关反应查找反应合适的条件 寻找相似结构的合成方法 寻找相似结构的合成方法示例 寻找相似结构的合成方法示例 通过相似结构的合成方法设计的路线 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 添加可相互转换的官能团示例 添加可相互转换的官能团示例 添加可相互转换的官能团设计合成路线 改变键的性质 添加可相互转换的官能团 添加可相互转换的官能团或改变键设计合成路线 查阅各核心结构的合成方法进行组装 使用Beilstein对复杂结构进行命名 使用Beilstein对复杂结构进行命名 如何将检索结果导出 Question Comments 限定检索结果的反应物为产物倒推合成路线 * Part III: 利用Beilstein 确定合成路线 * 首先检索文献有没有 相同分子的合成方法 有相同分子的合成 没有相同分子的合成 文献方法合理 文献方法不合理 (Cost, Scale up 设计新的合成路线 寻找相似结构 的文献合成方法 查阅核心结构进行组装 添加可以相互转换的 官能团或改变键的性质 采用文献路线 反应检索的基本原则 * 设计合成路线(一) * 尽量注意分子具有类似性,这样将其反应条件应用 到我们所要合成的分子中将更可靠. 变换官能团的取代位置,扩展检索范围 非反应的基团相同位置设为Free site 将分子中无关重要的非反应中心为部位变为Free site 设计合成路线(一) * 点击反应物,追溯文献合成路线 设计合成路线(一) * 设计合成路线(一) * 设计合成路线(二) * 文献中找不到类似结构的合成方法; 相关类似物的合成方法很少,找不到较为合适路线 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 设计合成路线(二) * 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 设计合成路线(二) * 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 设计合成路线(二) * 添加可相互转换的官能团或改变键的性质 设计合成路线(二) * 设计合成路线(二) * 设计合成路线(二) * 设计合成路线(二) * 设计合成路线(二) * 设计合成路线(三) * Part IV: 其他功能介绍 * 将Chemdraw不带缩写的结构复制到CrossFire 检索主页面,点击Autonom键 * * 药明康德新药开发有限公司 药明康德版权所有 * Part I: 基本检索方法介绍 * 打开Beilstein页面后选择数据库 选择数据库 * * 选择化学结构的绘图工具 选择绘图工具 使用较为方面, 一般是默认设置 * 编辑状态 选择结构或基团 橡皮 旋转 放大 缩小 画线 Clossfire 点击后进入检索页面 * 原子的定义 * 官能团的定义 * 最后的字母改为H,代表该结构和氢都可以。以下几个也是常用的:A:任意原子; Q:除C,H的原子 M:金属原子 X:卤素原子AH, QH, MH, XH则代表这类分子或氢原子 * 选择设定任意取代 取消任意取代 选择多个原子定义任意取代基 * 各种键的定义 * 单键,快捷方式 s + 回车 双键,快捷方式 o + 回车 三键,快捷方式 t + 回车 任意键,快捷方式 a + 回车 单或双键,快捷方式 i + 回车 双或单键,快捷方式 d + 回车 标示手性中心的实线,快捷方式 u + 回车 标示手性中心的虚线,快捷方式 w + 回车 手性中心的不,明,快捷方式 e + 回车 双键立体结构,快捷方式 b + 回车 各种键的定义和快捷方式详解 * 快捷方式打开后某类模板后则成默认方式,要打开其他模板从File工具栏打开 内存结构模板 * 使用CrossFire自带的模板介绍 氨基酸 芳环 原子链 环烷 杂环 天然产物 原子族 卟啉 其他 甾体 糖-线状 糖-环状 多萜 天然产物 核糖核酸 * 结构定义状态 画线将反应物和产物的共同原子连起 * 在定义状态下,单击反应连线的一端,跳出如右对话框,可设定反应中心 反应中心or非反应中心 及手性翻转情况(构象翻转or保持) * * 从ChemDraw中复制化学结构 使用方法: 从ChemDraw中复制结构后,在检索主
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