《两面针与混伪品及近缘种DNA条形码鉴定研究》.pdfVIP

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  • 2015-11-15 发布于河南
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《两面针与混伪品及近缘种DNA条形码鉴定研究》.pdf

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南方农业学报 JOURNALOFSOUTHERNAGRICULTURE 2014,45(1):12—17 ISSN2095—1191;CODENNNXAAB http://www.nfnyxb.cn DOI:10.3969~:issn.2095—1191.2014.1.12 两面针与混伪品及近缘种DNA条形码鉴定研究 马新业-,刘 锋 ,詹若挺 ,韩正洲 ,陈蔚文 (广州中医药大学 中药资源科学与工程研究中心,岭南中药资源教育部重点实验室,广州 510006; 华润三九医药股份有限公司 研发中心,广东 深圳 5181lO) 摘要:【目的】探讨DNA条形码技术对两面针真伪鉴定的可行性,为两面针种质资源的鉴定提供参考。 【方法】对 两面针及其常见混伪品和同属近缘种(10种31份样品)进行DNA提取、PCR扩增和双向测序,所得序列经CodonCode Aligner软件处理和人工校对,采用TaxonGap法比较rbcL、tmH-psbA和ITS2等3条序列的物种鉴定力大小;选择适用 条形码在不同物种样品范围内进行分析,检查种内种间距离变化情况。 【结果】ITS2和tmH-psbA两条序列对10个试 验物种的鉴定效率均为100.0%,rbc 实验物种范围内不存在最小种间遗传距离 ;ITS2序列在样品鉴定范围由12个 物种33个数据扩大为33个物种132个数据时,鉴定成功率从100.0%下降至84.8%,种内变异大于种间变异的比例由 71.4%上升至90.1%。 【结论】ITS2和tmH-psbA序列可作为两面针真伪鉴定的标准条形码,实际应用中应注意确定物 种鉴定样品数及种内充分取样。 关键词:两面针;DNA条形码;rbcL、trnH.一psbA、ITS2序列;鉴定效率 中图分类号:R282.5 文献标志码:A 文章编号:2095—119l(2014)叭一0012—06 IdentificationofZanthoxylum nitidum anditsadulterantsand relatedspeciesthroughDNA barcodes MAXin-ye,LIUFeng ,ZHANRuo-ting ,HANZheng-zhou ,CHENW ei-wen (ResearchCenterofChineseHerbalResourceScienceandEngineering,KeyLaboratoryofChineseMedicinalResourcefrom Lingnan/MinistryofEducation,GuangzhouUniversityofChineseMedicine,Guangzhou 510006,China;ChinaResourcesof SanjiuMedicalPharmaceuticalCo.,Ltd.,Shenzhen,Guangdong518110,China) Abstract:O【bjective】IdentificationofZanthoxylumniddumanditsadulterantsandrelatedspeciesthroughDNAbar- codeswasstudiedtoprovidereferencesforidentifyinggermplasmresourcesofZ nitidum.M【ethod]DNAextractedfrom31 samples(10species)wasamplifiedusingPCRandsequencedbidirectionally.Theobtainedsequenceswereprocessedbythe softwareofCodonCodeAlignerandcheckedbyproofreaders.SpeciesidentificationstrengthofthreecandidateDNAbarcodes

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