复杂生物性状局基因网络构建方法的研究.pdfVIP

摘 要 本课题的研究目的是构建出复杂生物性状的局部基因网络模式，并且运用构建的 局部基因网络模式作为分析复杂生物性状分子机制的手段。选取高血压、长寿和胚胎 干细胞的敏感基因作为研究对象，搜集并整合大量生物信号通路等基因相关信息，使 物性状的敏感基因之间的关联性做了初步分析，得到以下结论： l构建的高血压局部基因网络模式，包含22条信号通路作为连线，15个基因作为 节点，建立了64种连接方式的局部基因网络模式。随机选择其中的一种连接方式， 构画出了一张包含47个基因、9条信号转导通路的高血压局部基因网络图，其中， MAPK metabolism，Calciumsignalingpathway和 signalingpathway，Purine Adipocytokinesignalingpmhway分别控制多糖代谢、葡萄糖代谢和游离脂肪酸的代谢。 VEGF，GPCR，GS，PKG，RAP 基因的表达值下调。 3构建出人类长寿局部基因网络模式包含223种连接方式，19条信号通路，8个人 类长寿基因，5个连接基因和一个化合物(c00097)，以一种连接方式为依据得到人 类长寿局部基因网络图，包含17个基因和2个化合物。 4建立了线虫长寿基因网络，包含38个基因，6条信号通路，运用芯片数据分析． 寿命。 5建立了胚胎干细胞基因网络图，包含23个蛋白质和20个基因。利用芯片数据分 析，得出SOX2、OCT-4基因表达值上调，IGF．2、OCT-4基因表达值下调。 关键字：局部基因网络，高血压，长寿，复杂生物性状，信号通路，营养代谢 模块 ABSTRACT local network the wastoset a toconstructthe The of study upprotocol gene purpose mechanismof themolecular ofseveral analyze pattem complexbiologicalphenotypes，and the and biologicalphenotypesbyusing complex for the stemcellwereselected of studying maintenanceortransformationembryonic ofthethree collectedlotsof molecularmechanism complexbiologicalphenotypes．We the suchas from databases informationsignalingpathwaybiological by gene-relmed methods．KGMLEditornetwork interactinthe ofthebioinfo