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利用RILs群对水稻正季和再生季重要农艺性状的QTL比较分析.pdf
摘要
水稻多数性状是由多基因控制的数量性状,对数量性状基因位点进行鉴定在
作物遗传育种上具有重要意义。本研究以粳糯稻品种糯稻89.1为母本,籼稻品
种蜀恢527为父本进行杂交,从F2开始通过单粒传法获得重组自交系群体(RILs),
2007年正季种植F2:6群体,在当年正季考察了株高、有效穗、穗长等9个农艺
性状,再生季考察了有效穗、穗长、再生力等8个农艺性状,此外,利用该群体
还考察了水稻发芽率及芽期和再生稻桩耐寒性状,同时利用SSR标记构建遗传
图谱和对这些性状进行QTL定位分析,得到的主要研究结果如下:
1.在RILs群体中,所考察的性状均表现为连续变异,且都接近正态分布,
表明这些性状均为数量性状。方差分析表明,正季和再生季所有农艺性状株系间
基因型差异显著或极显著。表明该重组自交系群体内株系间存在广泛的遗传变
异。
2.对所考察的性状进行相关分析,发现多数性状存在相关性。在正季,株
高与齐穗期、结实率与千粒重等分别显著正相关,株高、穗长、每穗总粒数、每
穗实粒数四者彼此极显著J下相关,着粒密度、每穗总粒数、每穗实粒数三者彼此
极显著正相关,有效穗与穗长、每穗总粒数极显著负相关,千粒重与着粒密度极
显著负相关。在再生季,再生力与每穗总粒数、着粒密度显著负相关,与有效穗
极显著正相关,与芽期耐寒性显著正相关,其他农艺性状间的相关性与J下季的表
现规律相似。在两季均考察的7个性状中,同一性状两季间表现出极显著正相关,
其中千粒重的相关系数最大,接近1:正季有效穗、每穗总粒数、着粒密度、每
穗实粒数与再生季多数性状相关性达显著或极显著水平,而正季千粒重除与再生
季千粒重和着粒密度相关性达极显著水平外,与其他再生季性状相关性不显著。
3.选用SSR引物对双亲进行多态性检测,有118对引物在双亲间表现多态
性,用这些引物对169个株系进行检测,构建了一张包含105个分子标记、12
44.1
个连锁群的连锁遗传图,覆盖了水稻基因组ll cM,标记间的平均距离
为10.90
cM,采用基于最小二乘的复合区间定位法对上述性状进行了QTL定位。
4.对各性状分别进行QTL定位分析,所考察的性状均检测到了相应的QTL。
J下季共检测到QTL27个,分布在1、2、3、5、6、7、8、10染色体上,再生季
27个,分布在1、2、3、4、5、6、7、10染色体上。对正季和再
共检测到QTL
生季分别分析并比较两季检测到的QTL发现,在两季共同定位的7个农艺性状
中能同时检测到的QTL共有11个,分布于第l、2、6、7、10染色体上。分别
另外3个性状,即有效穗、每穗实粒数、结实率在两季中未检测到相同的QTL。
两季中,千粒重检测到的QTL重复率最高,共检测到5个相同的QTL,且同一
QTL在两季间贡献率大小表现稳定,表明千粒重性状表现受环境影响小。
本研究首次检测到2个新的控制再生力的QTL位点,分别是qRa4和qRa5,
分别解释表型变异的8.17%和7.09%。
2
本研究首次检测到2个耐寒主效QTL。其中控制水稻芽期耐寒性的QTL
生稻桩越冬耐寒性的主效QTL1个(qCtr5),与qCtb5位于同一标记区间。此
外,还检测到1个控制水稻发芽率的QTL(qGrl0)。
5.发现有控制不同性状QTL定位在同一位点或区域。如在第1号染色体上
的标记区间RM259RM220内同一位点,同时定位到控制每穗总粒数和着粒密
不同性状的QTL定位在同一位置或区域,可能是QTL紧密连锁或一因多效。研
究结果对指导水稻育种实践具有重要意义。
关键词:水稻重组自交系农艺性状耐寒性QTL定位
Abstract
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