有机化合物的弱相互作用及其定量结构-活性相关(QSAR)的分析.pdfVIP

有机化合物的弱相互作用及其定量结构-活性相关(QSAR)的分析.pdf

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摘 要 近年来,弱相互作用的研究受到了广泛的重视,其中二级化学键(Secondary chemicalbonds)是新发现的一种非相邻原子间的具有某些化学键性质的弱相互作 用。本论文以金属有机汞化合物为研究体系,应用分子图形学、分子力学 MMX 和半经验量子化学方法对二级化学键进行了研究,从能量和稳定构象的角度进行 计算和比较,证明了在这类金属有机化合物中存在着二级化学键,并且二级化学 键对分子的结构有重要的影响。 随着近代结构化学和计算化学理论、方法和工具的丰富以及计算机技术的迅 猛发展,使得合理药物分子设计有了巨大的发展。在2D-QSAR研究中,人工神经 网络方法被证明是较为有效的方法之一。本论文编写了人工神经网络中的误差反 传((BP)模型的程序,并且提出了批处理算法和改变学习速率的方法以加快收敛。 针对人工神经网络中的过拟合问题,在三个方面进行了研究:(1)对网络输入变量 进行筛选,提出了两种方法,即将人工神经网络的输入与多元线性回归分析相结 合;将人L_神经网络同主成分分析相结合。(2)网络合理结构的建立,确定隐含层 节点数。(3)交叉验证法训练网络。通过对单环芳香化合物的结构与生物降解性的 定量关系、神经网络预测含硫芳香族化合物的水解速率常数、磺酞脉类除草剂的 结构与活性相关三个体系的计算,得到了合理而可靠的预报结果,验证了以上方 法是非常有效的。 丫 、/ 关键词:弱相互作用,二级化学键,定量构效关系,人工神经网络,主成分分析, 误差反藻法,变颤哒 ABSTRACT Theresearchofweakinteractionshasbeenwidelystudiedinrecentyears. Secondarychemicalbondisakindofweakinteractionoccurringbetweenatoms,which arenotlinkedbynormalchemicalbonds,buthassomecharacteristicsofchemicalbonds. Usingmoderntheoryofchemicalbondaswellasthecalculatingmethodsofcomputer moleculargraphics(PCMODEL),molecularmechanicsMMXandsemi-empirical quantum chemistry (AM1,PM3),secondary chemicalbond,which existsin organomercurycompounds,wasstudied.Fromcalculatingandcomparingwiththe energyandstableconformationsofdifferentmolecularpairs,itwasconcludedthat secondarychemicalbondsareformedandhaveanimportanteffectonthestructuresof thesecompounds. Withtheaccumulationoftheories,methodsandtoolsofmodernstructuralchemistry andcomputationalchemistry,itisgreatdevelopedonreasonabledrugdesign.ANN (ArtificialNeuralNetwork)isprovedtobeanefficienttoolin2D-QSAR(Quantitative Structure-ActivityRelationship)study.Inthisthesis,programonBP(Back-Propagation) modelwasdesigned.Theconvergencespeedcanbeincreasedwithnewcontrolscheme oflearningstepandbatchprogramalgorithm.Inordertoavoidtheoverfittingproblem, threeaspectsarestudied: I VariableselectioninANNbycombiningANNwith

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