光棘球海胆cyp17基因的snps标记筛选及遗传分析-大连海洋大学.pdfVIP

第28卷第4期 大 连 海 洋 大 学 学 报 Vol.28 No.4 20 13 年 8 月 JOURNAL OF DALIAN OCEAN UNIVERSITY Aug. 2013 文章编号:2095-1388(2013)04-0373-05 光棘球海胆 CYP17 基因的SNPs标记 筛选及遗传分析 1、2 1、2 2 2 1、2 1 1、2 朱琳琳 , 王秀利 , 王洪迪 , 郭晓黎 , 常亚青 , 刘洋 , 仇雪梅 (1郾 大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室, 辽宁 大连 116023;2郾 大连海洋大学 水产与生命学院, 辽宁 大连 116023) 摘要:采用聚合酶链式反应、 单链构象多态性 (PCR-SSCP) 技术和基因测序方法筛选光棘球海胆Strongy鄄 locentrotus nudus细胞色素17琢羟化酶/ 17,20裂解酶 (17琢-hydroxylase/ 17, 20-lyase, CYP17) 基因编码区 单核苷酸多态性 (SNPs), 并进行了基于SNPs的遗传分析。 结果表明: 在 CYP17基因的270、 417、 666 nt 处均发生了碱基的点突变, 即G270A、 A417G和C666T, 前两个突变位点位于引物对 BF/ BR 的扩增产物 中, 后一个突变位点位于引物对CF/ CR的扩增产物中; 引物对BF/ BR 的扩增产物可形成3种基因型, 即 AA、 BB和AB基因型, A和B等位基因频率分别为0郾54 和0郾46, AA、 AB和BB基因型频率分别为0郾30、 0郾48和0郾22, 该座位的杂合度 (He)、 纯合度 (Ho)、 多态性信息含量 (PIC) 和有效等位基因数 (Na) 分别为0郾496 8、 0郾5032、 0郾3734 和1郾987 3; 引物对CF/ CR的扩增产物形成了两种基因型, 即CC和CD 基因型, C和D等位基因频率分别为0郾68 和0郾32, CC和CD基因型频率分别为0郾84 和0郾16, 该座位的 He、 Ho、 PIC和Na分别为0郾268 8、 0郾7312、 0郾2327 和1郾367 6。 遗传变异分析结果表明: 两个座位均属 于低度多态性, 而且群体遗传杂合度较低, 这反映了该群体的遗传一致性较高。 本研究筛选的3个 SNPs 为今后CYP17基因在光棘球海胆性腺生长发育研究上提供了前期科研基础。 关键词:光棘球海胆; CYP17基因; 单核苷酸多态性; 遗传分析 中图分类号: S917摇 摇 摇 摇 文献标志码: A 摇 摇 海胆不仅是重要的模式生物, 也是重要的海水 解酶 (17琢-hydroxylase/ 17, 20-lyase, CYP17) 是 养殖动物。 光棘球海胆Strongylocentrotus nudus、 虾 类固醇激素合成的关键酶之一,对生殖腺的生长和 夷马粪海胆 Strongylocentrotus intermedius 等已成为 发育起关键的调节作用[11-15]。 本研究中, 作者对 [1] 中国北方沿海养殖的重要海珍品 。 因海胆的主 光棘球海胆 CYP17 基因进行了单核苷酸多态性 要产品为生殖腺, 其生殖腺具有丰富的营养和药用 (SNPs) 的筛选及遗传学分析, 旨在为今后利用 价值, 因此, 部分学者开展了有关海胆生殖腺生长 SNPs分子标记辅助培育光棘球海胆的优良品种提 发育、 基因克隆表达等方面的研究。 如关于光棘球