牛α-actinin 1基因的克隆及其多态性与繁殖性状的关联分析.pdfVIP

维普资讯 畜牧兽医学报 2008，39(5)：540—546 ActaVeterinariaetZootechnicaSinica 牛wactinin1基因的克隆及其多态性与 繁殖性状的关联分析 淮亚红 ，许 尚忠 ，王淑辉 ，高 雪 ，陈金宝 ，任红艳 (1．西北农林科技大学动物科技学院，杨凌 712100；2．中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193) 摘 要 ：本研究以牛睾丸组织总 RNA为模板 ，采用 RT-PCR 的方法合成了tractinin1的 cDNA，并进行 了组织表 达谱和生物信息学分析 ，结果表明：牛a-actininI基因在肝脏、睾丸、肺、瘤 胃、子宫、小肠、脾脏、心脏、脂肪和肾脏组 织 中表达 ，cDNA为 2911bp，包含 2679个碱基组成 的开放读码框 (53~2731bp)，编码 892个氨基酸 ，主要包含 CH、SPEC和 EFh3个结构域 。此外，本研究以双胎和单胎鲁西牛、尼里一拉菲水牛、摩拉水牛、晋南牛、荷斯坦奶 牛、西 门塔尔牛和南阳牛为研究对象 ，通过测序和 PCR—RFLP相结合的方法进行 SNP检测和基 因型分析 ，探讨基 因多态性与产犊数之间的关系，结果表明：在 a-actininI基因第 13内含子的669bp处存在 1个 A／G 的突变 ，使得 产生 HaeⅢ多态 ，产生 AA和 AG2种基 因型；其基因多态性与产犊数之间的关联分析结果显示 A—G 的突变对 产犊数没有显著影响 (PO．05)。 关键词 ：牛 ；a-actinin1；多态性 ；克 隆 中图分类号 ：$823．2 文献标识码 ：A 文章编号 ：0366—6964(2008)05—0540—07 MolecularCloningofBovinea-actinin1Geneandthe AssociationofItsPolymorphism withtheReproductionTraits HUAIYa—hong一 ，XU Shang—zhong’ ，W ANG Shu—hui。， GA0 Rue。，CHEN Jin—bao。，REN Hong-yan。 (1．CollegeofAnimalScienceandTechnology，NorthwestAFUniversity， Yangling712100，China；2．InstituteofAnimalScience，Chinese AcademyofAgriculturalSciences，Beijing100193，China) Abstract：eDNA ofa-actininlgenewasclonedbyRT—PCR basedonthetotalRNA from bovine testicle．Furthermore，thesequenceofeDNA wasanalysedusingbioinformatics．A1-bdpairof primersandfl-actinpairofprimerswereusedtoamplifya-actinin1genebasedonthetotalRNA from 12bovinetissues，including liver，testicle，lung，rumen，uterus，smallintestine，spleen， heart，fat，ovary，kidneyandmuscle．In addition，mutationwasdetected byDNA sequencing andPCR—RFLPintwinningLuxicattle，Luxicattle，Nili-Ravibufflo，Murrah buffalo，Jinnan cattle，Holstein，SimmentalandNanyang cattle．Theresultindicated thattheeDNA sequence was2