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猪基因组信息资源的整合与利用 亓小红 吴克亮 （天津农学院，天津 300384） 摘要 猪基因组图谱已得到极大发展，猪基因组计划已启动并在实施之中。利用QTL扫描、候选基因分析、基因阵列分析、生物信息学、比较基因组学等工具，已经发现了很多影响猪主要经济性状的基因或基因标记。利用标记辅助选择，结合基因标记和常规生产性能信息，可以极大地改进养猪业重要的经济性状。本文对猪的基因组学、生长速度、瘦肉率、饲料吸收，肌肉品质、窝产仔数及疾病抗性等主要经济性状的研究进展及标记辅助选择在猪生产中的应用进行综述。 关键词：猪基因组，经济性状，QTL，候选基因， MAS Pig Genomic Information and It’s Application QI Xiao-hong (Tianjin Agricultural College, Tianjin 300384,China) Abstract The pig genetic linkage map and the physical genetic map are growing rapidly. The pig genome project has been initiated and further sequencing is now being considered. Using tools that include quantitative trait loci (QTL) scans , candidate gene analyses, gene arrays , bioinformatics, comparative genomics a number of important chromosomal regions and individual genes associated with growth rate, leanness, feed intake, meat quality, litter size and disease resistance have been identified. Using marker-assisted selection (MAS) the commercial pig industry is actively incorporating these gene markers and traditional performance information to improve traits of economic importance in pig production. Advances in pig genome and major traits and application of mark-assisted selection in pig production are reviewed. Key words: pig genomic information; pig economic traits; QTL，candidate genes, MAS 猪是人类最早驯化的家畜之一，作为世界的一个重要畜种，在地球上的分布很广。世界范围内的猪肉消费量占红肉消费量的43%。在我国肉类消费中，猪肉所占比例更高。除了提供肉类食品外，也是研究人类疾病理想Number of QTL by trait classes 性状（Trait Classs） QTLs 外部性状 31 健康性状 14 肉质性状 826 生产性状 196 繁殖性状 61 资料来源：/cgi-bin/QTLdb/summary 猪QTL数据库（PigQTLdb）收集了近10年所发表的所有的猪QTL数据。这些数据使得比较、证实、定位猪重要经济性状的基因成为可能。截止目前，该数据库共收集了86种杂志发表的235个性状的1129个QTL。尽管有大量的对家畜QTL检测的科学报道，大多数是利用品种或品系间的实验杂交群体进行的。这些研究在不同品种间得到的结果不同，也就不能用于不同品种的选择。但提供了在品种内分离的QTL的LD标记，可用于位置候选基因分析。 除QTL扫描外，候选基因分析也取得很大进展。对很多性状具有显著效应的候选基因已经发现[4]。如窝产仔数的四个候选基因，ESR，PRLR，RBP4，FSH?，由于遗传背景的不同，每个基因拷贝可增加窝产仔数0.25-1头；控制肥育、背膘性状的基因，特别是黑色素皮质激素4受体（melanocortin 4 receptor ，MC4R)基因与降低饲料吸收、加快生长、降低背膘厚显著相关[5]。与肉质有关的基因如HAL、RN基因已被广泛应用。几个与疾病抗性有关的候选基因或染色体区域也已得到，如K88R，FUT1，SL