藏绵羊DQA1基因多态性分析.pdfVIP

中国农业科学 2011,44(10):2146-2153 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.10.020 藏绵羊DQA1 基因多态性分析 1,2 1,2,3 1,2 2,3 2,3 成述儒 ，罗玉柱 ，胡 江 ，王继卿 ，刘 秀 1 2 （甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070 ； 甘肃农业大学甘肃省草食动物生物技术重点实验室，兰州 730070 ； 3 甘肃农业大学研究测试中心，兰州 730070 ） 摘要：【目的】研究藏绵羊DQA1 基因多态性，确定其等位基因数、核苷酸多态位点、氨基酸多态位点及各 等位基因间的遗传关系，同时分析其进化意义。【方法】采用PCR-SSCP 方法检测了900 只藏绵羊DQA1 基因第2 外显子多态性；克隆、测序群体内变异产生的各等位基因序列，并分析序列数据。【结果】发现了 17 个DQA1 的 等位基因，包括缺失的1 种基因，其中5 个为发现的新等位基因。16 个单倍型序列中发现56 个核苷酸多态位点， 27 个氨基酸多态位点。【结论】藏绵羊DQA1 基因第 2 外显子具有丰富的多态性，群体中可能蕴藏着更多的遗传 资源；藏绵羊DQA1 基因最初可能是由2 个等位基因突变分化成两大类等位基因的；藏绵羊DQA1 基因第2 外显子 序列与牛的DQA1 基因第2 外显子序列具有较高的同源性，预示绵羊和牛的DQA1 基因最早可能来源于它们分歧以 前的共同祖先原始序列；DQA1 基因在与其相关的特定抗原刺激下发生的免疫应答反应在绵羊和牛上具有相似性； 新等位基因C 的139 位发现了 1 个新的核苷酸突变位点（A/G），属同义突变；5 个新发现的DQA1 等位基因遗传 关系较近，可能由同一等位基因突变产生。 关键词：DQA1 基因；多态性；PCR-SSCP；藏绵羊 Polymorphisms of the DQA1 Gene in Tibetan Sheep CHENG Shu-ru1,2，LUO Yu-zhu1,2,3 ，HU Jiang1,2，WANG Ji-qing2,3 ，LIU Xiu2,3 1 2 ( Faculty of Animal Science and Techonology, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070 ；Gansu Key Laboratory of Herbivorous Animal Biotechnology 3 ，Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070 ；Analysis and Research Laboratory, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070) Abstract: 【Objective 】The Tibetan sheep DQA1 gene polymorphism, determine its allele number, nucleotide polymorphism sites, amino acid polymorp