藏绵羊基因OLA-DQA2第2外显子多态性分析.pdfVIP

中国农业科学 2009,42(8):2930-2936 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.08.035 藏绵羊基因 OLA-DQA2 第2外显子多态性分析 1,2 1 1,2 刘 秀 ，胡 江 ，罗玉柱 1 2 （甘肃省草食动物生物技术重点实验室/甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070 ； 甘肃农业大学研究测试中心，兰州 730070 ） 摘要： 【目的】针对藏绵羊腐蹄病所带来的死亡现象，选择与该病相关的基因OLA-DQA2 为研究对象，分析 群体中该基因的遗传多态性及变异特征，为进一步寻求抗病分子育种提供依据。【方法】采用PCR-SSCP检测216 只表型正常和患病藏绵羊 OLA-DQA2 基因第2 外显子的多态性，克隆、测序群体内变异产生的各等位基因序列，构 建系统发育树以明确藏绵羊 OLA-DQA2 基因等位基因之间的遗传关系。【结果】藏绵羊 DQA2 基因第 2 外显子中表 现了15个基因型。发现藏绵羊群体中 OLA-DQA2 基因第2外显子有8个新等位基因，分别命名为 OLA-DQA2*H、*I、 *J、*K、*L、*M、*N 和*O，使绵羊基因库中该座位的等位基因数量从 23 个增加到 31 个。序列分析中发现 71 个 核苷酸多态位点，这些多态位点主要由点突变形成，其中转换39个(占54.9%)，颠换23个(占32.4%)。【结论】 藏绵羊 DQA2 基因第2外显子具有丰富的遗传多态性，群体中可能蕴藏着更多的抗性遗传资源。 关键词：DQA2 基因；遗传多态性；PCR-SSCP；腐蹄病；藏绵羊 Polymorphisms of the Gene OLA-DQA2 Exon 2 in Tibetan Sheep 1,2 1 1,2 LIU Xiu , HU Jiang , LUO Yu-zhu 1 ( Gansu Provience Key Laboratory of Grazing Animal Biotechnology /Faculty of Animal Sci-Tech, Gansu Agricultural University , Lanzhou 730070 ; 2Analysis and Research Center, Gansu Agriculture University, Lanzhou 730070) Abstract: 【Objective 】 There is a foot-rot disease in the population of Tibetan sheep, which leads to the loss of sheep on death. Gene OLA-DQA2 is associated with foot-rot disease. The polymorphism and variation of gene OLA-DQA2 exon 2 was investigated in order to find the best alleles for foot-rot resistance in the further observation by means of phenotype and genotype. 【Method 】 Fragments of DNA containing OLA-DQA2 exon 2 were amplified usin