柑橘碎叶病毒外壳蛋白基因的克隆和序列分析.pdfVIP

中国农业科学 2009,42(10):3741-3748 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.10.046 柑橘碎叶病毒外壳蛋白基因的克隆和序列分析 宋 震，刘科宏，杨方云，唐科志，李中安，周常勇 （西南大学柑橘研究所/ 中国农业科学院柑桔研究所，重庆 400712 ） 摘要： 【目的】了解中国 CTLV 分离物外壳蛋白（CP）基因的变异情况。【方法】对来源于中国不同地区、 不同寄主品种的18个柑橘碎叶病毒（CTLV）分离物进行RT-PCR、克隆、测序，应用DNAMAN软件进行序列分析。 【结果】18 个分离物的 CP 基因全长 714 nt, 推导的 CP 含 237 个氨基酸。CP 核苷酸序列及推导的氨基酸序列最 大相似性分别为 88.5％～99.9％和 91.1％～99.6％。与核苷酸序列 G289 409 414 →A 或 C、A →C 和 G →T 的单碱基突变 相对应,CTLV 外壳蛋白第 97、137、138 位氨基酸在强、弱毒分离物之间存在差异，多数弱毒分离物为 Q97 97 或 K 、 Q137 138 97 137 137 138 、H ，而多数强毒分离物为E 、R 或K 、Q 。在根据CP氨基酸序列构建的系统进化树上，本研究获得的18 个CTLV分离物至少可以划分为2个组群，其中，在指示植物上表现较弱症状的多数(4/6)CTLV分离物划分在第Ⅰ 组群，多数(10/12)CTLV强毒分离物划分在第Ⅱ组群。【结论】CTLV外壳蛋白基因相对保守，其第289、409、414 位碱基在强、弱毒分离物之间存在差异，可能与病毒致病性相关。 关键词：柑橘碎叶病毒；CTLV；外壳蛋白基因；克隆；序列分析 Cloning and Sequence Analysis of the CP Gene of Citrus tatter leaf virus SONG Zhen, LIU Ke-hong, YANG Fang-yun, TANG Ke-zhi, LI Zhong-an, ZHOU Chang-yong (Citrus Research Institute of Southwest University, Citrus Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Chongqing 400712) Abstract: 【Objective 】 This study was conducted to investigate the molecular variability of the coat protein (CP) gene of Citrus tatter leaf virus (CTLV) isolates collected from China. 【Method 】 The CP gene of 18 CTLV