基于基因组学的作物种质资源研究：现状与展望.pdfVIP

中国农业科学 2015,48(17):3333-3353 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2015.17.003 基于基因组学的作物种质资源研究：现状与展望 黎 裕，李英慧，杨庆文，张锦鹏，张金梅，邱丽娟，王天宇 （中国农业科学院作物科学研究所，北京100081） 摘要：作物种质资源工作涉及面很广，包括种质资源的收集、编目、保护、繁种更新、分发利用与信息系统 建立等基础性工作，作物起源、驯化与传播、种质分类、民族植物学与传统知识研究等基础研究，遗传多样性评 价、重要性状表型鉴定、种质资源基因型鉴定、基因发掘和种质创新等应用基础研究。经过近百年的努力，种质 资源的基础性工作已卓有成效，作物种质资源保护与共享利用体系基本建立。但由于主要基于形态学的传统研究 思路和方法存在很多先天不足，种质资源基础研究和应用基础研究一直举步维艰，效率低下。随着分子标记技术 和第二代测序技术的快速发展，基因组学理论和方法不断深入到种质资源研究的多个层面，使种质资源保护和创 新利用发生了研究思路和方法学上的变革。基因组学研究成果为种质资源的有效收集和保护提供了理论指导，也 为阐明作物起源和演化、全面评估种质资源结构多样性提供了核心理论和技术，同时大幅度提高了基因发掘和种 质创新效率。特别是全基因组测序、重测序和简化基因组测序技术不断成熟，使在全基因组水平上比较不同种质 资源基因组变异成为可能；在此基础上，可阐明农作物起源以及驯化、改良和传播对种质资源形成的影响，明确 现有种质资源和野外种质资源群体结构和遗传多样性，提出种质资源异地保存和原生境保护的最佳策略；结合表 型鉴定数据，利用连锁分析和关联分析等基因组学方法，可高效发掘种质资源中蕴含的新基因和有利等位基因， 提出其利用途径和具体方案，并在种质创新过程中充分利用基因组学研究成果提高创新效率。文章评述了基因组 学在种质资源研究中的应用现状，特别是在种质资源基因型鉴定、异地保存和原生境保护、作物起源与进化研究、 结构多样性分析、新基因发掘和种质创新等方面的应用情况及其发展趋势。提出了今后的发展方向和工作重点， 强调把基因组学理论和方法与作物种质资源研究紧密结合，为种质资源的有效保护和高效利用提供强有力的理论、 技术、材料与信息支撑。 关键词：种质资源；基因组学；评述 Genomics-Based Crop Germplasm Research: Advances and Perspectives LI Yu, LI Ying-hui, YANG Qing-wen, ZHANG Jin-peng, ZHANG Jin-mei, QIU Li-juan, WANG Tian-yu (Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081) Abstract: The scale of activities related to crop germplasm is massive, including basic work (germplasm collecting, documentation, multiplication, conservation, regeneration, distribution and information system establishment, etc.), basic research (studies on crop origin, domestication and dispersal, germplasm classification, ethnobotany, indigenous knowledge, etc.), and applied basic research (genetic diversity assessment, preci