中国水稻条纹病毒两个亚种群代表性分离物全基因组核苷酸序列分析.pdfVIP

中国农业科学 2004,37 6 :846-850 ScientiaAgriculturaSinica 中国水稻条纹病毒两个亚种群代表性分离物 全基因组核昔酸序列分析 魏太云，林含新，吴祖建，林奇英，谢联辉 福建农林大学植物病毒研究所，福州 350002 摘要:首次测定了中国水稻条纹病毒 RSV 常年流行区云南楚雄 CX 分离物及病害暴发区江苏洪泽 HZ 分离物全基因组核普酸序列，其中CX分离物全长为17093nts,HZ分离物全长为17150nts。与已报道的日本T 分离物全长序列 17145nts 相比较，CX分离物变异较大。3个分离物基因组结构组成一致，5‘端和3‘末端非编 码区最为保守;7个编码区保守性次之;变异主要发生在IR上。同源性分析表明，HZ分离物与日本T分离物的亲缘 关系较中国2个分离物间的亲缘关系更为接近，这表明HZ和CX分离物基本上能够代表病毒自然种群中存在的2个 差异较为明显的亚种群。 关键词:水稻条纹病毒;全长序列;亚种群 AnalysisoftheCompleteNucleotideSequencesofTwoIsolatesof RiceStripeVirusRepresentingDifferentSubgroupsinChina WEITai-yun,LINHan-xin,WUZujian,LINQi-ying,XIELian-hui InstituteofPlantVirology,FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou350002 Abstract:ThecompletenucleotidesequencesofRNA1-4oftwoisolatesofricestripevirus RSV ,isolatedfrom Chuxiong CX ,YunnanProvince,andHongze HZ ,JiangsuProvince,weredetermined.Thecompletenucleotidesequences ofHZandCXisolateswere17150ntsand17093ntsinlength,respectively.Comparedwiththecompletenucleotide sequencesofTisolate 17145nts fromJapan,CXisolatevariedsignificantly.Thesethreeisolateshadidenticalgenomic characteristics.ThemostconservedregionsofRNA1-4amongthesethreeisolateslocatedin5and3U‘TR,andthemost variableregionsofthesethreeisolateslocatedintheIRsofRNA2-4.Comparisonofthenucleotideandaminoacid sequencesofsevenORFsamongthesethreeisolatesdemonstratedthatthecloserphylogeneticrelationshipbetweenHZ andTisolatesthanthatbetweenCXandHZisolates.TheseresultsshowedthattheHZandCXisolatescouldrepresent twosubgroupsofRSVinnaturalpopulationinChina. Keywords:Ricestripevirus;Thecompletenucleotidesequences;Subgroups 由水稻条纹病毒 ricestripevirus,RSV 久性方式经卵传播 〔〕‘。RSV具有独特的基因组结构 引起的水稻条纹叶枯病近年来在我国的发生呈上升 和表达策略，是研究植物病毒与寄主和介体互作及 趋势，2001-2003年又在江苏、河南的一些地区大 协同进化机制的模式对象。日本T分离物的全序列 范围暴发，而在云南、山东、河北、辽宁的一些地 已测定，基因组全长为17145nts，由4种单链RNA 区持续发生或流行。 组成，除RNA1采用负链编码外，RNA2^-RNA4皆采 RSV是纤细病毒属 Tenuivirus 的代表成 用双义编码策略2〔--5] 员，由灰飞虱 Laodelphaxstriatellus 以持 对中国RSV自然种群遗传结构分析的结果表 收稿日期:2003一07一30 基金项目:国家自然科学基金资助项目 座机电话号码,座机电话号码和座机电话号码 和高等学校全国优秀博士学位论文作者专项