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数量遗传学精要.ppt
数量遗传学 基本概念 数量性状 质量性状 表现型(phenotype),表现型变异(phenotypic variation) 基因型(genotype),遗传型变异(genotypic variation) 非遗传型随机误差(random error) 方差(variation)——个体的变异程度 公式:s2= 1/n [(x1- x )2+(x2- x )2+…+(xn- x )2] 有差、方、和、均四步运算。差是减法,方是平方,和是加法,均则为除法,就是求差、方的平均值,这也是“方差”的由来。 ②方差的单位是已知数据的平方单位。 标准差(Standard Deviation) 各数据偏离平均数的距离(离均差)的平均数,它是离差平方和平均后的方根。用σ表示。因此,标准差也是一种平均数标准差能反映一个数据集的离散程度。平均数相同的,标准差未必相同。 数量性状的遗传特征 加性效应(additive effect):基因位点内等位基因(allele)的累加效应 显性效应:(dominance effect):基因位点内等位基因(allele)之间的互作效应 上位性效应(epitasis effect) 加性-显性模型: 基因型值G=A+D+e 加性-显性-上位性模型: 基因型值G=A+D+I+e 遗传力:某性状的遗传变异占表现型变异相对比率 简单的数量性状 广义遗传力:总遗传变异(方差)/表型变异(方差) 狭义遗传力:加性遗传方差/表性方差 目前明确,群体表现型变异的遗传原因: 基因型变异、基因型*环境互作 普通广义遗传力,互作广义遗传力 加性-显性模型 加性-显性-上位性模型 主基因加多基因混合模型 数量性状基因定位 QTL(quantitative trait location) 单标记分析法 区间作图法 复合区间作图法 近亲繁殖与杂种优势 杂交hybridization 异交outbreeding 近交inbreeding 全同胞 full-sib 半同胞 half-sib first cousin 自交 Selfing 回交 Back cross 轮回亲本 recurrent parent 非轮回亲本 non- recurrent parent 近交指数(F) 个体某基因位点两个等基因来源于共同祖先某个基因的概率 近交与杂交的遗传学效应 遗传学效应 1. 基因分离 2. 等位基因纯合 回交意义 测交,3个遗传规律 纯合速度快 自交:每种基因型纯合速度: (1-1/2r ) n ×(1/2) n 回交 :纯合速度: (1-1/2r ) n 近交系数对群体表现的影响 近交衰退,群体均值下降 杂种优势 杂种优势涉及性状——大多为数量性状 双亲差异大、远缘 亲本高度纯合 理论基础: 显性假说dominance hypothesis 显性基因比隐性基因有利! A× B F1 超显性假说Over dominance hypothesis, super dominance hypothesis 等位基因异质结合 1908(Shull,G.H. East,E.M.)杂合性,引起某些生理刺激 1936(East,E.M.)补充:异质基因间的互作(显性作用) 1949,1955(Fisher,R. A.1949,Mather,K.1955): 数量性状基因各种遗传效应的综合作用(加、显、上位性及其与环境的作用) * * 个体的近交系数=双亲的共祖系数(0~1) 亲缘程度越紧,近交系数越大。 遗传性状稳定 F1(显性基因积聚) × F2 (隐性基因纯合) 被许多实验证实 局限性:显隐性关系,不能解释数量性状的杂种优势 *
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