第三章生物信息的传递从mRNA到protein精要.ppt

* 第四章 生物信息的传递—— 从mRNA到蛋白质 第一节 翻译的基本概念及有关的RNA 第二节 蛋白质合成的生物学机制 第三节 蛋白质运转的机制 第四节 蛋白质的降解 第三节： 蛋白质运转的机制 第四节: 蛋白质的降解 ---生物体内蛋白的降解是一个有序的过程。 ---不同蛋白质其半衰期差异较大。 ---蛋白质半衰期与N端氨基酸残基有一定关系 蛋白酶 （肽酶） 肽链内切酶 肽链外切酶 二肽酶 组织蛋白酶 肽链内切酶 胃蛋白酶 ：水解芳香族氨基酸的—NH2形成的肽键。 胰蛋白酶 ：水解碱性氨基酸的—COOH形成的肽键。 胰凝乳蛋白酶 ：水解芳香族氨基酸的—COOH形成的肽键。 肽链外切酶 氨肽酶 羧肽酶 泛素调节的理论基础 生物体内存在着两类蛋白质降解过程，一种是不需要能量的，比如发生在消化道中的降解，这一过程只需要蛋白质降解酶参与，可以在小肠内将食物降解为氨基酸；另一种则需要能量，它是一种高效率、指向性很强的降解过程。比如多数细胞内的蛋白质降解需要能量，这是由于在细胞内蛋白质的降解过程中发生了一系列的反应，最终使得将要被降解的蛋白质被一种多肽链所标记，这就意味着细胞对蛋白质降解具有很高的选择性，这种标记势必需要一定的能量，而这种能量在生物体内是以三磷酸腺苷的形式提供的。 赫尔什科 切哈诺沃 罗斯 2004年诺贝尔化学奖被授予以色列科学家阿龙·切哈诺沃、阿夫拉姆·赫什科和美国科学家欧文·罗斯，以表彰他们发现了细胞是如何摧毁有害蛋白质的. （即泛素调节的蛋白质降解） 泛素调节的蛋白质降解 蛋白质的降解是一个精细控制的过程，首先有待降解的蛋白质被一种多肽（称之为泛素）所标记，接着这些蛋白质进入细胞的蛋白酶复合体中，蛋白酶复合体是一个上下有盖的圆桶状酵素，它们如同细胞的垃圾桶，专门负责蛋白质的分解及再循环利用，泛素在这一过程中释出讯号，让蛋白酶复合体分辨出有待降解的蛋白质。 泛素—蛋白酶体途径( upp )的组成 ---泛素—蛋白酶体途径( upp )由泛素( ubiquitin, ub)以及一系列相关的酶组成。 ---除泛素以外还包括4 种酶家族: 泛素活化酶( ubiquitin - activating enzyme, E1 ) 、 泛素偶连酶( ubiquitin - conjugating enzymes, E2 s) 泛素-蛋白连接酶( ubiquitin - ligating enzymes, E3 s) 蛋白酶体(proteasome) ---蛋白的泛素化和去泛素化都需要多种酶介导 ---upp既有高度底物多样性又具有针对不同调控机制的多样性。 泛素的结构与组成 泛素含有76个氨基酸残基,广泛存在于真核生物,目前尚未发现泛素存在于原核生物中，泛素的氨基酸序列极其保守。泛素基因主要编码两种泛素前体蛋白质:一种是多聚泛素,另一种是泛素融合蛋白。 泛素—蛋白酶体途径( upp )一系列相关的酶 泛素活化酶( E1 )是催化泛素与底物结合所需的第一个酶。细胞内仅有单一的泛素活化酶基因。利用不同的转录起始点,它可产生E1 a 和E1 b两种泛素活化酶,它们的生物功能可能有所不同。 泛素偶连酶( E2 )是泛素与蛋白底物结合所需的第二个酶。细胞内有多种泛素偶连酶基因,大多数泛素偶连酶有一个14～16 KD的核心,含有活性所必需的半胱氨酸残基。在不同的泛素偶连酶间有约35%的同源性,这一区域可能参与泛素偶连酶和蛋白底物的结合。 泛素-蛋白连接酶是泛素与底物蛋白结合所需的第三个酶。泛素-蛋白连接酶在决定泛素介导的底物降解方面有特殊的作用。不同类型的泛素-蛋白连接酶间缺乏序列同源性,而且分子量差异较大. 蛋白酶体是催化泛素与底物蛋白偶联体降解的关键酶,复合体共同结合装配而成,此组装过程需要耗能。 细胞内的废弃物处理装置——蛋白酶体 一个细胞大约含30000个细胞废弃物处理装置即蛋白酶复合体——蛋白酶体，这些桶状结构可以几乎将所有蛋白质分解为7-9个氨基酸长度的缩氨酸，蛋白酶体的活性表面在桶状结构的内部。蛋白酶体能辨别出与泛素结合的蛋白质，一旦作为标签的泛素脱离蛋白质，即可利用三磷酸腺苷提供的能量改变蛋白质的性质使其从一端进入蛋白酶复合体内发生降解，并最终以缩氨酸的形式从另一端释放出来。这一过程如此复杂，需要消耗能量。然而蛋白酶体并不能选择待降解的蛋白质，细胞内主要是通过E3类酶的特异性选择并利用泛素加以标签，从而选择正确的待降解蛋白质。 黑点表示活性区域，蛋白质降解的场所 泛素化和去泛素化 泛素通过E1和E2被激活的过程称为泛素的活化。