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杜鹃花属药用植dna条形码的鉴定研究
中文摘要
DNA条形码技术是利用一段(或几段)通用的、相对较短且具有足
够变异的易扩增的DNA片段对物种进行鉴定,它是依据DNA]g/段在物种
内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的物种鉴别方法,能够实现对
物种的快速和较客观的鉴定。本文选用生物多样性丰富且药用资源较多的
杜鹃花属植物作为对象进行DNA条形码鉴定研究。
为评价和比较几个热点推荐的DNA条形码候选序列对杜鹃花属药用植
序成功率、种内和种间变异,进行barcodinggap分析,采用BLASTl和
Nearest Distance方法评价四个不同序列的鉴定能力。结果显示:
psbA-trn腑列在所研究的杜鹃花属药用植物中的测序成功率为86.8%,
,6以序列为89.7%,核ITS2序列仅为50%;psbA-trnH序列提供了最大种间
变异且Wilcoxon检验表明其种间最小变异明显大于其种内最大变异,较有
barcoding
利于物种的鉴别; gap-与其他DNA条形码候选序列相比具有明
序列扩大应用至94个样品,依然具有93.6%的鉴定成功率,即使对于其中
属甚至是一个组或一个亚组,将其确定到一个较小的分类范围,具有一定
鉴定意义。因此,psbA-trnH序列可以作为这四个序列中杜鹃花属植物条
形码首先推荐的序列。
有关杜鹃花属的属下分类一直存在争议,由于psbA-trnH序列在杜鹃
花属物种的鉴定方面表现出了较好的鉴定能力,本研究运用psbA-trn腑
列的测序结果,选用杜鹃花属7个亚属37个物种的样本,用MEGA4.0进行
相关数据分析,并构建聚类树,对杜鹃花属各个亚属的分类地位进行了探
讨,为进一步深入研究杜鹃花属植物的亲缘关系提供分子系统学证据。结
果表明杜鹃花属37个种的样本聚为7枝,与《中国植物志》上分类系统相
符,支持《中国植物志》杜鹃花属下亚属的分类系统。这也从系统进化的
角度,证实了psbA-trntt序列在杜鹃花属植物分类和鉴定中的作用。
杜鹃花属药用植物同名异物、同物异名现象严重,混淆品和伪品较多,
ITS2片段在中药材的物种鉴定方面具有潜在的研究价值。本文考察利用
ITS2序列对杜鹃花属10种常用中药原植物进行鉴别的可行性,为ITS2
序列准确鉴别这些药用植物提供分子证据,结果表明ITS2作为DNA条形
码序列能够准确区别10种杜鹃花属药用植物。
发育
i Ci naI
i forChi neseMed
AssessmentofcanddateDNAbarcodes
PI antsfromGenusRhododendron
i aI i i enceofChi neseMateri aMedi ca
Specty:Sc
i mei Li u
Author:Y
Tutor:KeI.Chen
Abstract
DNA iSa new toolfor and
barcoding biological accurately
ectivelident ies US shortandStandardDNA
specby ing
obj y ifying
ionsthatcanbe ifledeasi PCR.Oneofthe
reg ampl lyby problems
wasthatthe Studieswere
in DNAbarcodereseaches previous
plant
carrledo
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