拟南芥和水稻CesA基因家族的生物信息学分析.pdfVIP

河南农业科 学，2015，44(6)：13—17 JournalofHenanAgriculturalSciences doi：10．15933／j．cnki．1004—3268．2015．06．003 拟南芥和水稻 CesA基 因家族 的生物信息学分析 王振怡，王金朋 ，潘玉欣 ，张家琦 ，王希胤 (河北联合大学 生命科学学院基 因组学与计算生物学研究中心，河北 唐 山063009) 摘要 ：以拟南芥和水稻 21个纤维素合成酶基因 (CesA)为研 究对象，对其基因结构、保 守结构域、蛋 白质跨膜结构、亚细胞定位、基因表达等进行综合分析。结果显示，CesA基 因长度在 3．5～6．5kb， 有 7～13个 内含子 (OsCesAlO除外)。CesA基 因编码的蛋 白质保 守性较强，含有该基 因家族的保 守 结构域 Ringfinger(OsCesAlO、OsCesA1 除外)和 Cellulosesynthase。水稻和拟南芥 的CesA蛋 白跨 膜螺旋数量为6个或 8个(OsCesA10除外)。蛋白质亚细胞定位结果表 明，21条 CesA蛋 白全部定 位在质膜上。大部分AtCesA基因在植株的幼根 、幼叶和愈伤组织中均有表达 ，而大部分 OsCesA基 因仅在幼根或幼叶 中表达 。 关键词 ：纤维素合成酶基 因；拟南芥；水稻；生物信息学；基因表达 中图分类号：Q51；s511 文献标志码 ：A 文章编号 ：1004—3268(2015)06—0013—05 BioinformaticAnalysisofCesA GeneFamilyinArabidopsisandRice WANG Zhenyi，WANG Jinpeng，PAN Yuxin，ZHANG Jiaqi，WANG Xiyin (CenterforGenomicsandComputationalBiology，CollegeofLifeSciences，HebeiUnitedUniversity Tangshan063009，China) Abstract：Inthisstudy，twenty—onecellulosesynthasegenes(CesA)fromArabidopsisandricewereana— lyzedintheirstructures，conservativemotifs，proteintransmembranehelices，protein subcellularlocations andgeneexpressions．TheresultsshowedthatthesizeofCesA ranged from 3．5 to6．5 kb．with7一 l3 smallintrons(exceptOsCesAlO)．CesA hadhighlyconservedstructurewiththefamilydomain “Ringfin— ger”(exceptOsCesAlOandOsCesAl1)and “Cellulosesynthase”．Thenumberofproteintransmembrane helicesinArabidopsisandricewas6or8(exceptOsCesAl0)，respectively．Thesubcellularlocations showedthatthe21CesA proteinswerealllocatedonthemembranes．MostoftheAtCesA genesexpressed inyoungroot，young leavesand calluses，whereasmostoftheOsCesA expressed only in youngrootor young leaves． Keywords：cellulosesynthasegene(CesA)；Arabidopsis；rice；bioinformatics；geneexpression 纤维素是植物细胞壁 的主要组成部分 ，其决定 许多研究表明，植