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- 2016-04-14 发布于安徽
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Tittle: 2012荷兰格罗宁根大学食物检测
Text:by groningen university team
Background:每年全世界将近13亿吨食物被扔掉,大部分是由于超过不准确的保质期,一个可靠的检测食物是否腐烂的系统能够节约金钱和减少食物浪费。
Brief introduction:食物检测是一个用来检测食物破坏的系统,它使用枯草芽孢杆菌,它们对于腐肉气体的基因反应已经被鉴定,连接到一个色素产生系统。这样消费者就可以通过肉眼判断肉是否已经腐烂!
Operating principle:腐肉挥发物能够激活PsobA启动子,进而触发色素产生(蓝色或黄色)
Construction:所使用的结构是简单且高效的,在腐肉激活启动子的调控下将会色素产生。当枯草芽孢杆菌感应到腐肉挥发物的存在时,腐肉激活启动子将会被激活,将允许下游基因的表达。我们将色素基因插入其下游,使其由启动子控制,所以基因将表达当启动子活跃的时候。我们使用枯草芽孢杆菌的主要质粒(Bba-k818000)包含sacA、氯霉素抗性基因(用来检验染色体整合和筛选)且这个backbone有E-coli的复制原点,所以它能够应用与大肠杆菌。
紧接着,我们又加入另外的一个检测线路,使用PwapA启动子,当存在腐肉挥发物时,该启动子被关闭,当肉是新鲜的时,该启动子活跃。
①腐肉挥发物到达枯草芽孢杆菌
②PsboA启动子激活BBa-k818100
③色素产生
新原件:
1.BBa-k818000:结合链:与枯草芽孢杆菌的染色体结合于SacA位点且在大肠杆菌中复制,由psac-cm导出。
2.BBa-k818600:腐肉传感系统:包含原始枯草芽孢杆菌启动子PsobA(BBa-k818100)和amilGFP黄色蛋白携带rbs(BBa-B0034),PsobA可以由腐肉挥发物强烈的激活当枯草芽孢杆菌呈指数增长时,可以在6个小时后,产生明显的黄色。
先前原件:
BBa-K592010,2.BBa-K592009;3.BBa-K823023;
BBa-K818100;BBa-K818400
Pathway:经过社会调查,明确了研究方向,收索资料,查阅文献,确定研究材料,通过建模,优化结构,进行市场调查和实际实践,优化检测元件,使其能够推广且安全。
Biobrick:
submitted biobrick
BBa-k818000:这个原件是设计来满足我们项目中工作枯草芽孢杆菌的backbone的,这个质粒由Psca-Cm通过插入一个生物砖酶切微点,一个终止子(BBa-B0015)在suffices序列的后面和红色荧光蛋白的序列(RFP)在其多重克隆微点(MCS)。具有多寄主复制原点,可在大肠杆菌中复制。质粒跟sacA结合。质粒设计成结合一个克隆的插入到枯草芽孢杆菌via染色体,构建质粒和sacA之间的双重组。这使得在枯草芽孢杆菌的双向问题易于检测,正确插入插入物的将无法代谢蔗糖。
另外一个优点是,它能复制跟枯草芽孢杆菌的染色体紧密结合的质粒,这样一旦插入并表达成功,将不需要再次进行抗性筛选,这使得克隆更容易且稳定。
终止子插入到红色荧光蛋白序列的后缀之后,这使得克隆更快更容易,新的生物砖可以插入到这一端基因线路,通过更换rfp生物砖,E-coli 转化体将不会产生红色。(因其rfp基因被取代)
质粒被导入到任何具有氯霉素抗性的枯草芽孢杆菌168寄主中,质粒能在经过氯霉素或氨苄青霉素筛选的大肠杆菌中被放大。使用红白显示,红色荧光蛋白不能由枯草芽孢杆菌产生。
BBa-K818100HeBBa-K818200
SboA和Fnr 是两个枯草芽孢杆菌的启动子,是对于腐肉挥发物最为敏感的两个。
BBa-K818400,BBa-K818500和BBa-K818600
大多数表达基因的编码器,在sboA启动子的控制下,当sobA启动子被激活则下游的表达基因将被表达,产生对应产物。
BBa-K818210和BBa-K818310
红色荧光蛋白基因的编码器,由fnr启动子控制,还有AmliGFP,由alsT启动子管理,当启动子被激活时,下游的表达基因将表达出对应产物。
Application:通过检测食物腐烂程度,减少食物浪费和资源浪费,给消费者一个准确的食物保质期,亦可保护消费者的身体健康。
Summarize:腐肉检测系统本身是一个传感器或者说是感应器,我们以根据其思路,制作出自己的传感器。例如金属探测细菌来寻找矿物或者地雷。
当然我最感兴趣的是“kill switch”,不管任何工程细菌,检测细菌等到他们工作完成时,我们应将其杀死,并要将其对环境的影响降低到最低,死亡开关则是一个相对较好的方法。要解决的问题有怎样杀死,什么时候
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