DNA结合蛋白(韩超杨文飞).ppt

DNA结合蛋白 成员：韩超 杨文飞 DNA结合蛋白 转录水平的调节主要依赖于DNA结合蛋白，通过对多种不同调节蛋白的研究，发现他们可归属于几种类型，每种类型都具有共同的结构特征，下面介绍几种典型的蛋白家族。 亮氨酸拉链结构 1.是出现在DNA结合蛋白质和其它蛋白质中的一种结构基元。2.当来自同一个或不同多肽链的两个两用性的α-螺旋的疏水面（常常含有亮氨酸残基）相互作用形成一个圈对圈的二聚体结构时就形成了亮氨酸拉链。 3.亮氨酸拉链是由伸展的氨基酸组成，每7个氨基酸中的第7个氨基酸是亮氨酸，亮氨酸是疏水性氨基酸，排列在α-螺旋的一侧，所有带电荷的氨基酸残基排在另一侧。当2个蛋白质分子平行排列时，亮氨酸之间相互作用形成二聚体，形成“拉链”。在“拉链”式的蛋白质分子中，亮氨酸以外带电荷的氨基酸同DNA结合。与DNA的特异性结合都是以二聚体的形式起作用的，与DNA的结合区域并不在拉链区。 锌指结构 锌指结构由一个α-螺旋和两个反平行的β-折叠三个肽段组成。形似手指，具有结合锌离子的功能。锌指的N-端有一对半胱氨酸残基，C-端有一对组氨酸残基，这四个残基在空间上形成一个洞穴，恰好容纳一个Zn离子，由于Zn离子可稳定模体中α-螺旋结构，致使此α-螺旋能镶嵌于DNA的大沟中，因此含锌指结构的蛋白质都能与DNA或RNA结合。 锌指结构 Arg和G形成氢键 螺旋-转角-螺旋结构 1.这是最早在原核基因的激活蛋白和阻遏蛋白中发现的调控蛋白, 是一种同型二聚体。 2.构成同型二聚体的每个单体由20个氨基酸残基的小肽组成α螺旋-转角-α螺旋结构, 含有一个α螺旋、一个转角、另一个α螺旋，其中一个螺旋为识别螺旋(recognition helix), 负责识别DNA大沟的特异碱基序列。另一个螺旋没有碱基特异性, 与DNA磷酸戊糖链骨架接触。在与DNA特异结合时, 以二聚体形式发挥作用, 结合靠蛋白质的氨基酸侧链与特异碱基对之间形成氢键。 β- 折叠 反平行β-折叠与DNA大沟结合，亦多数是二聚体。 分解代谢物控制：感知能量状态 大肠杆菌乳糖操纵子的正调控 葡萄糖效应：培养基中有葡萄糖存在时，即使有乳糖存在，不诱导靶基因表达。这样的操纵子称葡萄糖敏感操纵子。这种效应由一种正控制机制决定。 葡萄糖抑制操纵子的原理：　葡萄糖 腺苷酸环化酶活性降低 ATP无法转变成cAMP 不能形成CAP-cAMP复合蛋白 RNA酶无法结合在DNA上 结构基因不表达。 葡萄糖降低cAMP水平的机制是什么？ 希望大家批评指正！ * 下一张 亮氨酸拉链结构 上一张幻灯片 蛋白质的氨基酸侧链与特异碱基对之间形成氢键。 TBP(一种转录因子)用一个插入双螺旋小沟的β折叠来结合并扭曲DNA DNA结合蛋白  无葡萄糖 腺苷酸环化酶活性激活 ATP可以转变成cAMP 能形成CAP-cAMP复合蛋白 RNA酶可以结合在DNA上 结构基因表达。 大肠杆菌乳糖代谢的调控需要三种酶参加: ①. β-半乳糖苷酶：将乳糖分解成半乳糖和葡萄糖 ②. 渗透酶：增加糖的渗透，易于摄取乳糖和半乳糖 ③. 转乙酰酶：β-半乳糖转变成乙酰半乳糖 大量乳糖时：大肠杆菌三种酶的数量急剧增加，几分钟即可达到千倍以上，这三种酶能够成比例地增加. 乳糖消耗完：这三种酶的合成也即同时停止. 葡萄糖可以阻遏β-半乳糖苷酶的产生 cAMP可以克服由葡萄糖引起的阻遏作用 葡萄糖抑制了cAMP的生成 磷酸转移酶系统PTS中可诱导组分ⅡAglu 是整个控制系统的中心,ⅡAglu控制腺苷酸环化酶的活性但不控制其合成 系统中的有些蛋白与一定的糖有专一性，在糖类物质跨膜转运时将PEP上的磷酸基团在蛋白间不断转移，最后到达ⅡAglu上，使其磷酸化，从而与腺苷酸环化酶作用激活其活性。 有葡萄糖跨膜时，ⅡAglu 上的磷酸基团会转移到葡萄糖上，会形成6-磷酸葡萄糖（G6p），脱磷酸化的ⅡAglu与腺苷酸环化酶结合抑制其活性，从而引起胞内cAMP下降 PTS 系统负责特异地将葡萄糖从细胞外跨膜主动运输进入细胞, 并在此过程中, 将葡萄糖磷酸化为葡萄糖-6-磷酸, 进入糖酵解途径 *