遗传学第二章孟德尔式遗传预案.ppt

遗传统计方法简介 概率论与二项式 生男育女費猜疑 生男育女本是極平常的事，其或然率卻可用二項式的展開式來預測。設生男的機會為p，則育女的機自為1-p或q。在理論上 ，若一對夫婦一連生下二個小孩，其生男育女之或然率為： (p+q)2=p2+2pq+q2 二個都是男的機會為 ；一男一女的機會為 ；二個都是女的機會為 ， 假如一連生下三個小孩，其生男育女之或然率為： (p+q)3=p3+3p2q+3pq2+q3 連生三個都是男孩的機會為 ；二男一女的機會為 ，一男二女的機會為 ；一連生三個千金的機會為 。 數學家喜歡用一般式來表示二項式展開式； n=小孩子的數目； m=生男發生之次數；p為生男的機會，q為育女之機會。 問；在10個小孩的家庭裏，6 男 4 女發生之機會為多少？ 答：  X2試驗 顯著程度的統計試驗通常在決定所得的數據是否足以證明某一假設。統計與遺傳的書籍都描述各種試驗的方法並指明在何種情況要用何種方法。 其中最常用的方法為 (chi square)試驗，該方法可用於遺傳學上的很多種問題。 之計算甚為簡易。假如O為各種項目之觀察數據， E為各種相對項目之預期數據，則：  如此所得之值，可由已知的表上(Fisher,1944)查出或然率p，若p0.05表示有意義之差異。也就表示觀察到的數據與預期的並不符合。 問：在一些先天性幽門狹窄症的病人當中，有男孩25名與女孩5名；此種比例是否與正常男女比例有差異？ 答：如表二所示，先作試驗之分析，得知其p0.01，因此先天性幽門狹窄症的患者當中，男女人數之比例與正常男女人數之比例有顯著之差異。換句話說男孩罹致此種疾病之或然率較高。 自由度v=（行数-1）（列数-1） χ2 检 验(chi-square test) 第一节 χ2分布和χ2检验的步骤 第二节 完全随机设计下两组频数分布的χ2检验 第三节 完全随机设计下多组频数分布的χ2检验 第四节 配对设计下两组频数分布的χ2检验 第五节 χ2检验要注意的问题 第六节 四格表的确切概率法 一、χ2分布 χ2分布是一种连续型随机变量的概率分布。 图 若干χ2分布的概率密度曲线 二 、?2检验的基本步骤 1.建立假设 H0：无效假设 H1：备择假设 2.确定检验水准α 3.选择检验方法，并计算检验统计量 4.确定P值，作出推断结论 P≤α，拒绝H0，接受H1 P＞α，不拒绝H0 ?2检验的基本公式  ?2 =∑（A－T）2/T 式中A代表每个格子的实际频数( actual frequency )，即表中的基本数据；T代表每个格子的理论频数( theoretical frequency ) 一、 二分类情形—2×2列联表（两个率比较） 例7-1 某医师研究用兰芩口服液与银黄口服液治疗慢性咽炎疗效有无差别，将病情相似的80名患者随机分成两组，分别用两种药物治疗，结果见下表： 药物 疗效 合计 有效 无效 兰芩口服液 41(36.56) 4(8.44) 45(固定值) 银黄口服液 24(28.44) 11(6.56) 35(固定值) 合计 65 15 80 慢性咽炎两种药物疗效资料 建立检验假设并确定检验水准 H0:两药的有效概率相同，π1=π2 H1:两药的有效概率不同，π1≠π2 α=0.05 2. 计算检验统计量：H0成立时，两组有效概率相同，近似地等 于合并估计的有效概率，由此得到四格表中每一格的理论数， 自由度为：ν=(行数-1)(列数-1)=(2-1)(2-1)=1 3. 确定P值 查附表8 4. 结论：按α=0.05水准，拒绝H0，接受H1，两样本频率 的差别有统计学意义。可以认为，兰芩口服液和银黄口服 液的总体有效概率不同。前者(91.1%)高于后者(68.6%). 处理 属性 合计 阳性 阴性 1 组 a(T11) b(T12) a+b(固定值) 2 组 c(T21) d(T22) c+d(固定值) 合计 a+c b+d n 完全随机设计下两组频数分布的四格表 四格表专用公式：(T?5,且n ? 40) 四格表校正公式 ：当(1?T＜5,且n ? 40)需校正 二、多分类的情形—2×C列联表（两个构成比比较） 例7-2 1986年某地城市和农村20至40岁已婚妇女避孕方法情 况，试分析该地城市和农村避孕方法的总体分布是否有差别？ 组别 避孕方法 合计 节育器 服避孕药 避孕套 其他 城市 153 33 165 40 391 农村 320 75 43 18 456 合计 473 108 208 58 847 两种疗法缓解率的比较 处理 属性（水平） 合计 1 2 … C 1组 A11（T11） A12 （T12）