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- 2017-05-15 发布于江苏
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生物信息学展望
摘要:
生物信息学是生物技术的核心, 是一门由生物、数学、物理、化学、计算机科学、信息科学等多学科交叉产生的新兴学科。世纪的生命科学研究对人类科学、文化、经济、政治和生活等各方面产生了极大的影响。尤其是人类基因组计划(H G P) 的提出和实施, 不仅带动了自然科学和人文社会科学的交叉与融合, 而且推动了许多高新技术的发展和新兴学科的产生。本文介绍了生物信息学的概念, 分析了发展生物信息学对现今科学发展的重大意义。分析了生物信息学发展的方向, 展望了生物信息学的发展前景
关键词:生物信息学;新兴学科;生物信息论
正文:生物信息学是近20年迅速发展起来的一门新兴交叉学科。生物信息学是英文单词 Bioinformatics的中文译名,美籍马来西亚裔学者HwaA.Lim在1991年发表的文章中首次使用,但至今尚无完善的科学定义。笔者综合大量文献认为如下叙述可以作为生物信息学的定义:生物信息学是应用计算机技术管理生物信息,交叉了生物学、数学、物理学、化学、计算机科学等众多学科的新兴学科20世纪80年代末,人类基因组计划的启动推动了生物信息学的产生和蓬勃发展。1999 年,有关生物信息学的相关网页不到200个,2001年初近2 000个;2002年初(3月29日)搜索,中文网页8730个,英文网站94个,网页475000个。
同样,随着科技的日益发展,人们对于生物信息学的理解和认识也越来越加深,也越来越重视。随着人类基因组计划的实施,数学、物理、计算机科学、信息科学等日益渗入生物学,生物信息学正逐渐发展成为一门独立的学科。生物信息学也并非是生物学或信息科学的一个简单的分支,它是多学科的有机交叉。同时它先进的信息技术和数理技术研究生命现象, 它将帮助人们逐步认识生命的起源、进化、遗传和发育的本质, 破译隐藏在DNA序列中的遗传信息, 揭示人体生理和病理的分子基础, 为人类疾病的预测、诊断、治疗和预防提供最合理、最有效的方法和途径。生物信息学的发展将会对生命科学带来革命性的变革。它的成果不仅对相关基础学科起巨大的推动作用, 而且还将对医药、卫生、食品、农业等产业产生巨大的影响, 甚至引发新的产业革命。因此, 各国政府和工业界对此极为重视, 投入了大量资金。更有许多商业机构介入其中, 为生物信息学的发展注入了强大的活力。生物信息学产生的效益是相当惊人的。
那么,生物信息学的主要内容是什么呢?其实就是数据库。目前世界各国纷纷建立了生物信息数据库,其数量成爆炸性增长,几乎覆盖了生命科学的各个领域。主要有美国国立卫生研究院全国生物技术研究中心(NCBI)的GenBank,欧洲生物信息学研究所(EBI) 的EMBL数据库,日本国立遗传学研究所(NIG)的DNA数据库,瑞士生物信息学研究所(SIB) 的SWISS PROT,美国Brookhaven国家实验室(BNL)的PDB。NCBI开发的ENTREZ系统综合了上述各大数据库的信息和MEDLINE的文献信息。
为了更好地发展生物信息学,目前世界各国都成立了相应的生物信息学研究机构。欧美各国及日本相继成立了生物信息数据中心, 如美国的国家生物技术信息中心(NCBI),英国的欧洲生物信息研究所(EBI),日本的国家遗传学研究所(NIG)等。其中,以欧洲各国为主的欧洲分子生物网络组织是目前国际上最大的分子生物信息研究、开发、服务机构,通过计算机网络使英、法、德、瑞士等国家生物资源实现共享。
在我国, 生物信息学随着人类基因组研究的展开才刚刚起步, 但已显露出蓬勃发展的势头。在政府的支持和科学家的呼吁下, 国家级生物医学信息学中心正在筹建之中。北京市已经成立了北京生物工程学会生物信息学专业委员会( 即北方生物信息学研究会) , 目的在于联合北方地区从事生物信息学的专家, 加强合作, 促进学科的发展, 并为政府决策提供参考意见。我国生物信息学的发展也面临着许多制约因素。比如人才资源匮乏,人们对生物信息学的认识不够, 投入不足等。
生物信息学的主要任务是人类基因组信息结构复杂性的分析和破译遗传语言,以及基因组功能相关信息分析和服务。作为计算机科学和数学应用于分子生物学而形成的交叉学科,生物信息学已经成为基因组研究中必不可少的有力研究手段。面对挑战, 生物信息学在21 世纪的发展进程中, 应该考虑到它的历史使命。在今后的工作中, 将会做好以下几个方面的工作:
理论研究。(2)软件开发。(3)集成数据库。(4)生物数据的质量监控。(5)学科交叉。
生物信息学的发展前景是难以预测的, 但总体来讲, 生物信息学的发展将会带来生物科学的一次历史性的革命, 对推动生物科学的发展、增进人类对自身的了解、增进人类对大自然的了解, 所起的作用将是不可估量的,并且我坚信生物信息学的前景一片光
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