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环介导等温扩增技术原理;等温扩增技术简介
等温扩增技术的应用前景
几种等温扩增技术比较
环介导的等温扩增技术原理
环介导的等温扩增演示
环介导的等温扩增检测
;等温扩增技术(Isothermal Amplification Technology)是核酸体外扩增技术,其反应过程始终维持在恒定的温度下,通过添加不同活性的酶和各自特异性引物(或不加)来达到快速核酸扩增的目的。
与PCR技术相比核酸等温扩增对仪器的要求大大简化,反应时间大大缩短,更能满足快速简便的需求。
;特异性高
分析速度快
成本低
突变率低
不需要升温降温过程,一台的加热器即可操作
检测核酸成分比检测微生物本身危险性小
方便诊断
;环介导核酸等温扩增技术(LAMP)
滚环扩增技术 RCA
单引物等温扩增 SPIA
依赖解旋酶的等温扩增技术 HAD
链替代扩增 SDA
交叉引物扩增技术 CPA
核酸依赖性扩增检测技术 NASBA
Qβ复制酶反应
;;LAMP克服了传统PCR反应需要通过反复热变性获得单链模板的缺点,避免了反复升降温的过程,实现了恒温条件下的连续快速扩增,具有更高的灵敏度和扩增效率。
操作简单:只需一个水浴锅
快速高效:不需要预先的双链DNA热变性.避免了温度循环而造成?的时间损失
特异性强:针对靶序列6个区域设计的4种特异性引物。6个区域中任何区域与引物不匹配均不能进行核酸扩增。故其特异性极高。?
高灵敏度,对于病毒扩增模板可达几个拷贝,比PCR高出数量级的差异。
缺点:由于LAMP扩增是链置换合成,靶序列长度最好在300?bp以内。500?bp则较难扩增。故不能进行长链DNA的扩增。灵敏度高易造成假阳性结果。
;环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification ,简称LAMP)是利用4个特殊设计的引物和具有链置换活性的Bst DNA聚合酶,在恒温条件下特异、高效、快速地扩增DNA的新技术。
LAMP技术以其特异性强、灵敏度高、快速、准确和操作简便等优点在核酸的科学研究、疾病的诊断和转基因食品检测等领域得到了日益广泛的应用。;60—65℃是双链DNA复性及延伸的中间温度,DNA在65℃左右处于动态平衡状态。利用引物合成的DNA链取代模板互补链。
①扩增目的片段时依赖的是一种具有链置换特性的Bst DNA聚合酶
②需四条能够识别靶序列六个特异区域的引物
③LAMP法并不需要对双链DNA进行预变性及进行温度循环。?;针对靶基因的六个不同的区域,基于靶基因3’ 端的F3c、F2c和Flc区以及5’ 端的Bl、B2和B3区等6个不同的位点设计4种引物。
LAMP反应的开始阶段四条引物都被使用,但在循环阶段则只有内引物被使用。
FIP(Forward Inner Primer):上游内部引物,由F2区和F1C区域组成,F2区与靶基因3’端的F2c区域互补,F1C区与靶基因5’端的Flc区域序列相同。
F3引物:上游外部引物(Forward Outer Primer),由F3区组成,并与靶基因的F3c区域互补。
BIP引物:下游内部引物(Backward Inner Primer ),由B1C和B2区域组成,B2区与靶基因3’端的B2c区域互补,B1C域与靶基因5’端的Blc区域序列相同。
B3引物:下游外部引物(Backward Outer Primer ),由B3区域组成,和靶基因的B3c区域互补。
;
;内引物FIP的F2与其模板的互补序列F2c结合,在Bst DNA聚合酶作用下,从F2的3’末端开始启动DNA合成,合成一条以FIP为新的DNA单链并与模板链结合形成新的双链DNA。;以F3为起始合成的新链与模板链形成双链。而原合成的以FIP为起始的DNA单链被置换而脱离产生一单链DNA,其在5’末端F1c和F1区发生自我碱基配对,形成茎环状结构。?;引物BIP的B2与模板链B2c区互补配对,合成以BIP为起始的新链,并与模板链互补形成DNA双链。同时,F端的环状结构将被打开,外引物B3与模板上B3c杂交后,以其3’末端为起点也开始合成新链,并使以BIP为起始的DNA单链从模板链上脱离下来,形成以FIP和BIP为两端的单链。因为B1C与B1互补,F1C与F1互补,两端自然发生碱基配对,这条游离于液体中的DNA单链分别在F和B末端形成两个茎环状结构,于是整条链呈现哑铃状结构,此结构即为LAMP的基础结构。;乔岩梅.??炭疽芽孢杆菌特征基因恒温扩增检测方法的研究[D].?
中国科学院研究生院(武汉病毒研究所)?2007;反应结束后对扩增产物的检测常使用焦磷酸酶沉淀检测(浊度检测)、荧光检测、凝胶电泳检测等。?
焦磷酸酶沉淀的检测(浊度检测):在LAMP反应过程中,dNTP析出的焦磷酸根离子与反应溶液中的Mg2+结合
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