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第3章转录资料
转录及其调控;转录(transcription);原核生物转录;原核生物转录酶及相关因子;原核生物转录相关因子
ρ因子:六聚体蛋白、依赖ATP的解旋酶活性。
其他因子:nusA蛋白,识别新和成RNA分子中的终止信号;原核生物转录过程;;转录起始的过程:
核心酶在σ因子的参与下,与模板DNA接触,生成非专一性的,不稳定的复合物在模板上移动
起始识别:σ亚基发现识别位点后,与-35区序列结合形成一个封闭的启动子复合体“酶-启动子二元复合物”;全酶紧密地结合在启动子的-10序列处,模板DNA局部变性,形成“开放的启动子二元复合体”
酶移动到转录起始点,第一个rNTP转录开始, σ因子释放,形成“酶-启动子-rNTP三元复合体”;RNA链的延伸
核心酶向前移动, NTP不断聚合,RNA链不断延长
核心酶覆盖双链DNA和RNA复合物,向前推进,边解开螺旋边释放出新合成的RNA链,已经转录的区域中分开的DNA链又重新形成双螺旋;原核生物转录终止
终止子:DNA分子中终止转录的核苷酸序列 。
不依赖Rho (ρ)因子的转录终止
依赖Rho (ρ)因子的转录终止;真核生物转录;真核生物转录酶及相关因子;RNA聚合酶I的启动子 ;RNA聚合酶Ⅱ启动子;;负责转录的是5SrRNA、tRNA和某些snRNA
5S rRNA和tRNA基因的启动子是内部启动子位于转录起始位点的下游;转录因子 (transcription factor, TF):是一类细胞核内蛋白因子,通过与顺式作用元件和RNA聚合酶的相互作用调节转录的活性
基本转录因子—RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子
特异转录因子—结合在转录核心元件以外的其他上游顺式作用元件的蛋白因子,通过DNA与蛋白之间的相互作用影响转录的效率;真核生物RNA-pol不与DNA分子直接结合,而需依靠众多的转录因子;真核生物转录的终止;真核生物RNA成熟;真核生物mRNA的成熟;;2) 3’端加尾及其功能;RNA的剪接;内含子的分类;3)mRNA前体( hnRNA )的剪接;1)边界序列:5’-GU…...AG-OH-3’
2)分枝点顺序:内含子3′端上游
3)依赖于snRNPs进行剪接
4)内含子5’端有一保守序列5’GUAAGUA3’,和剪接体中U1 snRNA的5’端的3’CAUUUCAU5’互补;RNAaseP切除5’端前导序列
RNAaseD切去3’端附加顺序,加上-CCA-OH
通过剪接去除内含子
核苷酸修饰形成???有碱基;真核生物rRNA的成熟;RNA编辑 ;转录调控;原核生物转录调控的特点;操纵子(operon):是原核生物DNA上的一段区域。是由若干功能相关的结构基因和控制这些基因表达的元件组成的一个完整、连续的功能单位;操纵子的基本组成;1.乳糖操纵子;mRNA;mRNA; 阻遏蛋白的负性调节 —— 可诱导调控
1) 无乳糖存在时,阻遏物可以结合在操纵基因上 → 阻止转录过程 → 基因关闭;
2)有乳糖存在时,乳糖→半乳糖与阻遏物结合→阻遏物变构 → 阻遏物不能结合操纵基因 → 转录进行 → 基因开放。;CAP的正性调节;+ + + + 转录; ; ;原核生物转录终止调控;色氨酸操纵子的结构;色氨酸操纵子的转录调控机制;(2)色氨酸操纵子转录的衰减调节;真核生物转录调控;真核生物转录调控的特点;真核生物转录前调控;DNA的修饰:甲基化与去甲基化
DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。
甲基化常发生在基因5′侧区的CpG序列中,阻碍转录因子与DNA特定部位的结合;真核生物转录水平调控;顺式作用元件
启动子(promoter):RNA聚合酶结合并起动转录的DNA序列
①核心启动子 : 指RNA聚合酶起始转录所必需的最小的DNA序列
②上游启动子元件: 包括-70bp附近的CAAT盒和GC盒以及距转录起始点更远的上游元件。
增强子(enhancer):远离转录起始点、决定基因的时间、空间特异性、增强启动子转录活性的DNA序列;增强基因转录效应十分明显
发挥作用与其方向或转录起始点的距离无关
大多数为100-200 bp重复序列,其基本核心组件常为8-12bp
没有基因专一性
有严格的组织细胞特异性
活性与其在DNA双螺旋结构中的 空间方向性有关
许多增强子作用的发挥还受外部信号驱使;沉默子(silencer):负性调节元件。当其DNA序列与特异蛋白因子结合后,可阻断转录起始复合物的形成和活化,使基因表达的活性受到抑制。功能不受距离和取向的限制;DNA结合域;螺旋—回折—螺旋(helix-turn-helix ,HTH)
锌指结构(zinc finger)
亮氨酸拉链(leucine zipper, bZIP)
碱性-螺旋-环-螺旋(helix-l
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