高级生物化学-氨基酸重点.ppt

第3章 氨基酸(amino acids);一、蛋白质的水解;A. 胰蛋白酶( trypsin ) 专一裂解Lys、Arg的羧基参与形成的肽键（后为Pro时抑制）。为了减少的作用位点，可用化学修饰将多肽链侧链保护起来，1.2-环己酮封闭Arg，马来酸酐封闭Lys。氮丙啶形成带正电荷点，增加位点。 B. 糜蛋白酶(Chymotrypsin) 断裂Phe,Trp,Tyr等疏水AA的羧基所形成的肽键。后为Pro时抑制 C.胃蛋白酶(Pepsin)（在Leu,Phe,Trp,Tyr后） 断裂键两侧的殘基都是疏水性或芳香氨基酸残基。其后和前为Pro时抑制。;(1).羧肽酶(carboxypeptidase)法，（Pro不能测） ;1、不同氨基酸的R基不同，R基决定了氨基酸的性质 2、兼性离子→晶体溶点高→离子晶格，不是分子晶格。 3、溶解性：一般都溶于水，不溶或微溶于醇 4、介电常数高→水溶液中的氨基酸是极性分子。;蛋白质氨基酸 ; 基本氨基酸的分类-方式1;（1）侧链为烃链的氨基酸;（2）. 侧链含有羟??的氨基酸 （2种）;（3）.侧链含硫原子的氨基酸;两个半胱氨酸氧化可以形成胱氨酸;（4） 侧链含有羧基或酰胺基的氨基酸（4种）;（5）. 侧链含有碱性基团的氨基酸（3种）;碱性氨基酸;乙酰-CoA羧化酶的组成;(6)、R为芳香族基团的氨基酸（3种）; R为芳香族基团的氨基酸;(7) 杂环氨基酸：脯氨酸;基本氨基酸结构特点小结;按侧链R基极性分类; 1. nonpolar (hydrophobic) amino acids.;2. Polar Uncharged Amino Acids; 组氨酸 赖氨酸 精氨酸 侧链有咪唑环 侧链有?-氨基 侧链有胍基;4. Amino acids with acidic side chains;;极性与非极性与蛋白质空间结构形成密切相关;氨基酸的疏水性和蛋白质三维结构;氨基酸的疏水性和蛋白质三维结构;氨基酸的疏水性和蛋白质三维结构;Folding proceeds via intermediate steps, forming molten globule – which is refined to minimum energy (native) state Free energy difference between folded and unfolded structure is ~ 42 kJ/mole (about the same as 1.5 ATP) Because folding is cooperative, once a protein begins to fold or unfold, the entire process is completed quickly. 维持蛋白质三维结构或DNA 双螺旋最稳定的因素是（？）;基本氨基酸的分类-方式3;;基本氨基酸其他分类方式;基本氨基酸其他分类方式;;基本氨基酸其他分类方式;2、不常见蛋白质氨基酸;不常见蛋白质氨基酸及非蛋白质氨基酸;：存在于生物体内，但不组成蛋白质的呈游离或结合态的氨基酸，约150种，具有多种生理功能。 （1） L-α-氨基酸的衍生物 L-瓜氨酸和L-鸟氨酸是合成精氨酸的中间产物。 （2）D-α-氨基酸 D-Ala存在于肽聚糖中，D-Phe是短杆菌肽S的组分 （3）β、γ、δ-氨基酸 β-Ala是泛酸的前体，γ-氨基丁酸是传递神经冲动 的化学介质。 ;真核生物中的D型氨基酸;四、氨基酸的酸碱性质; triprotic; 氨基酸的解离;甘氨酸的解离曲线;氨基酸的解离-- pKa值;氨基酸解离的PKa;氨基酸氨基和羧基的解离和PKa值;Titrations of polyprotic amino acids;Titrations of polyprotic amino acids;Henderson-Hasselbalch equation;Ans: pH = pKa + log [A-]/[HA] pKa – pH = log [HA]/[A-] antilog (pKa – pH) = [HA]/[A-] antilog (6.0 – 5.4) = [HA]/[A-] 4 = [HA]/[A-] or 4[A-] = [HA] Therefore, at pH 5.4, 4/5 (80%) of the histidine will b