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nanodropnd-1000
超微量分光光度計 (NanoDrop Spectrophotometer)
壹、用途說明
ND-1000 一、簡介
ND-1000超微量分光光度計是NanoDrop的第一個產品,應用液體的表面張力特性,只需要1~2ul樣品,在偵測台上,經上下臂的接觸拉出固定的光徑(1mm及0.2mm)達到快速、微量、高濃度、免石英管、免毛細管等耗材偵測吸收值的優點。此產品設計受專利保護,並在全世界廣受歡迎,其準確度與便利性讓科學家得以更有效率進行各項研究(網頁連結:/nd-1000-testimonials.html)。
ND-1000使用高能量氙燈(pulsed xenon flash lamp)可提供220~750nm的全光譜偵測,且不需要暖機,開機後可立即使用。搭配高感度CCD array偵測器,偵測吸收值可高達75Abs(dsDNA濃度2~3700ng/ul),大部分純化後的核酸幾乎都不需要稀釋即可偵測。
待測樣品的均質性是ND-1000的最高要求,一般核酸、蛋白質樣品能在偵測前以vortex mixer震勻為最佳,若無vortex mixer也應以pipette吸放數次混勻。若擔心genomic DNA可能因前述動作而斷裂,則改以55?C加熱約一分鐘,使樣品在偵測前呈現均勻狀態。
偵測時選擇不同偵測模式,可以得到最快速的結果:
Nucleic Acid – 吸收光譜、230nm, 260nm, 280nm吸收值(換算成10mm光徑吸收值)、260/280 ratio、260/230 ratio及核酸濃度。
UV-Vis – 220~750nm間所有波長的吸收值及光譜(以1mm光徑吸收值呈現)。
濃度範圍:
樣品種類 最低濃度 最高濃度 (超過此濃度請稀釋樣品) 再現性 (五重複以上) 核酸 2 ng/ul 3700 ng/ul (dsDNA)3000 ng/ul (RNA)2400 ng/ul (ssDNA) 濃度範圍在 2-100 ng/ul 時,SD為 ± 2 ng/ul濃度範圍大於 100 ng/ul 時,CV為 ± 2% 純BSA 0.10 mg/ml 100 mg/ml 濃度範圍在 0.05-10 mg/ml 時,SD為 ± 0.10 mg/ml濃度大於 10 mg/ml 時,CV為 ± 2% 二、使用方法舉例
dsDNA:
在主畫面點選Nucleic Acid,依軟體跳出對話框動作(確認台面清潔,並在偵測台上點1ul二次水,放下上臂後再按OK)完成電腦與儀器連線。依照DNA所溶於之液體準備該溶液(務必確認DNA溶於二次水、TE buffer或哪一組kit的elution buffer)取出1.5~2 ul點在偵測台上,放下上臂後再按Blank。在右上方拉選Sample Type DNA-50,在Sample ID位置輸入樣品名稱,將樣品混勻,取出1.5~2 ul點在偵測台上,放下上臂後再按Measure。《示範影片》
結果:
DNA濃度即以65.003 x 50 = 3250.1算出。 260/280介於1.8~2.0通常代表此為較純的DNA(隨DNA組成不同會有差異)。 260/230高於260/280,介於1.8~2.2通常表示純化過程殘留污染物較少。若欲察看220~340nm間其他波長的吸收值,可使用滑鼠拉動位於230nm的直線,或在右邊λ處輸入其他數值。
三、結果整理:
當次偵測完的所有樣品可按Show Report得到,此report可另存為ndj檔案,使用excel開啟。不同天的結果,可從Data Viewer內選Import Samples,將欲放在同一份report內的樣品挑選出來產生一份新的report。《示範影片》
四、注意事項:
1. 嚴禁使用測定蛋白質
2. 偵測後立即使用拭鏡紙(Kimwipe類)擦拭台面。先取一張將上下台面的液體吸走,再將此laboratory wipe吸過樣品的面反折到內部,折疊四次後以單方向多次擦拭台面(DNA 擦 5次,Protein 擦 20次)。《示範影片》
3. 同一滴液體只能做一次偵測,欲重複定量同一樣品,請擦掉前一滴,重新取出一滴進行偵測。
4. 基本上核酸樣品可使用1~2ul做測量,隨各液體體積特性之不同會有不同體積需求,原則上不超過 2ul。並請使用2ul pipette避免體積不足導致液柱無法完整形成。唯蛋白質樣品因呈色劑與蛋白質本身特性,務必使用2ul進行偵測。
5. 當軟體跳出錯誤訊息時,請詳細閱讀並依指示進行障礙排除。最常發生的情形是在偵測過程液柱並未正確形成,軟體會出現以下訊息。可先用肉眼觀察液柱是否未完整連接上下台面,或樣品內有泡泡,將上臂拉起後,擦掉該滴樣品,再重新進行偵測,必要時可將樣品體積加大至2u
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