ICAM―1K469E基因多态性与IS相关性研究.docVIP

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ICAM―1K469E基因多态性与IS相关性研究.doc

ICAM―1K469E基因多态性与IS相关性研究   摘要: 目的: 探讨细胞间黏附分子-1(ICAM-1)K469E 基因多态性与缺血性脑卒中(IS)遗传易感性的关系。方法: 应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测、分析病例与对照两组间ICAM-1 K469E基因型及等位基因频率分布的差异。结果: IS病例组和对照组的ICAM-1K469E 基因各等位基因频率、基因型分布相比均无统计学差异(P0.05 )。结论: 衡阳市人群中IS 遗传易感性与ICAM-1 K469E 基因无明显关联。   关键词: 细胞间黏附分子-1;基因多态性; 缺血性脑卒中   资助项目:2012年衡阳市科技计划一般项目(项目编号)2012KS22   脑卒中是严重威胁人类的三大疾病之一,具有发病率高、患病率高、致残率高、复发率高的特点,给社会和家庭带来沉重的负担。脑卒中患者中缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)占59.8%[1]。迄今为止,关于IS的发病机理还远未阐明,而随着分子生物学技术的发展,IS相关基因的定位和识别已成为研究的热点。研究发现细胞间黏附分子-1(intercellular adhesion molecule-1,ICAM-1)在动脉粥样硬化的形成中发挥着十分重要的作用,其基因多态性与IS的关系也倍受研究者关注[2]。但是ICAM -1 K469E基因多态性是否为IS的危险因素尚难肯定。而且由于IS是多因素、多基因相互作用的疾病,在促进IS发生的过程中,ICAM-1 K469E基因多态性与IS其他危险因素之间是否存在交互作用,国内外亦未见此类报道。本研究采用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,检测ICAM-1 K469E基因多态性在病例组和对照组中的频率,同时应用多因素统计方法,分析其在IS发病中的作用,为我国开展脑血管疾病的预防和基因治疗提供科学依据。   1 资料与方法   1.1 临床资料 IS病例来源于2013年5 月~2014年11月南华大学附属第一、第二医院神经内科,对照来源于同一医院其他患者或健康体检者。采用1:1比例配对,病例、对照各确定为220例。对照组与病例组性别、民族相同,年龄相差不大于5岁,职业、经济状况、居住环境等比较无统计学意义,具有可比性。所有患者均无血缘关系。均经神经内科专家诊断,符合该病诊断标准,全部研究对象均取得知情同意。排除糖尿病、恶性肿瘤、肝肾功能不全、甲状腺疾病、接受器官移植、严重营养不良等疾病。   1.2 主要试剂 PCR 引物序列由上海生物技术有限公司设计;Taq 酶系、dNTP(美国 promega公司);红细胞裂解液(德国BAG公司)。   1.3 检测方法   1.3.1 标本收集与基因组DNA提取 取每例患者和正常对照组外周静脉全血3m1 分别加入EDTA抗凝管中,采用酚氯仿法从外周静脉全血中提取人全基因组DNA。   1.3.2 IC M-1K469E基因扩增 上游引物:5,-GGGCCAGGAGCACTCAA G-3,,下游引物:5,-CGGTGAGGATTGCATTAGGT-3,。PCR体系总体积为40ul,包括DNA模板2ul、2mmoL/LdNTP 4ul、PCR 缓冲液4ul,上、下游引物 Taq DNA聚合酶0.4ul。PCR 反应条件:95℃预变性15min,94℃ 30s、56℃ 60s、72℃60s, 共35循环,再于72℃延伸7min。3%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。   1.3.3 连接酶检测反应 (LDR )及测序仪电泳 对获得的PCR 扩增产物进行多重LDR,通过测序仪电泳读取检测结果 。   1.4 统计学方法 所有数据统计均由SPSS13.0统计软件包完成。基因型频率的分布经 Hardy-Weinberg 平衡检验。ICAM-1基因型、等位基因计数用直接计数法,并计算基因型及等位基因频率,组问比较采用χ2检验。以 P ≤0. 05 为差异有统计学意义 。   2 结果   2.1 ICAM-1K469E等位基因测定 应用 Gene-mapper进行数据分析分出3种基 因型,分别为ICAM-1AA 型(数据分析图上于82 处出现一波峰,A等位基因纯合子)、A/G 型(数据分析图上于82、84 处出现2个波峰,杂合子)、G G 型(数据分析图上于84处 出现一个波峰,G等位基因纯合子)。   2.2 ICAM-1 K469E 基因型和等位基因频率分布对照组和IS病例组 ICAM-1 K469E 基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P 0.05)。对照组AA 型、GG 型、AG 型K469E基因型频率分别为 63.64%(35/5

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