掺杂玉米茶叶的基因组DNA提取与PCR检测方法建立.docVIP

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掺杂玉米茶叶的基因组DNA提取与PCR检测方法建立.doc

掺杂玉米茶叶的基因组DNA提取与PCR检测方法建立   摘要:根据玉米内源ZEIN基因建立了茶叶中掺杂玉米的普通PCR和实时荧光PCR检测方法。结果表明,标准CTAB法适合提取茶叶样品基因组DNA,实时荧光PCR的灵敏度能达到0.1%,普通PCR能达到1%,实时荧光PCR是普通PCR的10倍。两种方法都能达到检测要求。   关键词:茶叶(Camellia sinensis);玉米(Zea mays);普通PCR;实时荧光PCR;检测方法   中图分类号:Q78;S571.1 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2013)22-5615-03   目前,我国的茶叶(Camellia sinensis)年消费量已高达66万t,人均饮茶量0.45 kg/年。茶对我国的社会历史文化和现实生活都产生了重要影响[1]。茶叶质量安全主要包括茶叶掺假、农药残留、重金属污染、有害微生物污染、磁性物和粉尘污染等因素[2,3]。其中茶叶中掺假的问题近年来越发严重,一些不法商贩为了获取高额利润在茶叶中掺杂各种谷类物质,以次充好,以假冒真。茶叶掺假的方式有:以类似茶叶的其他植物叶冒充茶叶;在真茶叶中掺入假、次茶叶;晒干饮用过的茶叶重新销售等[4]。此外,茶叶中还出现了掺淀粉、甘薯粉、面粉或其他谷类淀粉加水、加热促成淀粉糊,于茶叶初制或再加工过程中加入,其目的或是将末茶重新造形,促成条状;或是将粗老茶特别是回笼茶(泡过的茶叶)揉成条,并增进重实感;或是利用淀粉糊的黏性,掺入一些沙土、木灰、煤屑等以增重;或上述掺伪兼而有之[5]。   PCR技术具有快速、灵敏、特异性高的特点[6],已广泛应用于食品、饲料中外源成分的检测。本研究根据玉米(Zea mays)内源ZEIN基因建立了茶叶中掺杂玉米的普通PCR和实时荧光PCR检测方法,以期能够快速、准确地检测出茶叶中掺杂的玉米。   1 材料与方法   1.1 材料与仪器   茶叶和玉米购自宁波市欧尚超市散装商品(样品在小型食品加工机中充分加工成细粉)。Taq DNA聚合酶和dNTPs等PCR试剂购自生工生物工程(上海)股份有限公司。   1.2 基因组DNA的提取   称取含有10%玉米的茶叶样品200 mg和纯玉米样品20 mg分别采用标准CTAB法[7]、改良CTAB法[8]和试剂盒法提取两种样品基因组DNA,用U-0080D型生物分光光度计测定基因组DNA浓度。   1.3 不同浓度梯度玉米的茶叶样品基因组DNA的提取   将玉米样品掺入到茶叶中,分别配制成浓度为10.0%、3.0%、1.0%和0.1%的茶叶样品,并利用标准CTAB法提取基因组DNA,用U-0080D型生物分光光度计测定基因组DNA浓度。   1.4 PCR 扩增   1)实时荧光PCR扩增[9]。实时荧光PCR扩增体系参照One Step PrimeScriptTM RT-PCR Kit说明。20 μL反应体系为:20 μmol/L 上、下游引物各0.4 μL、20 μmol/L荧光探针0.8 μL、50×ROX Reference Dye 0.4 μL、2×TaKaRa Premix Ex Taq 10.0 μL、Rnase-free water 4.0 μL,DNA模板4.0 μL。每样品设一个平行反应,并设置阴性对照与空白对照。反应程序为:95 ℃ 2 min;95 ℃ 5 s,60 ℃ 31 s,40个循环。   2)普通PCR扩增[10,11]。普通PCR反应体系为:20 μmol/L上、下游引物各0.4 μL、Rnase-free water 5.2 μL、2×Taq Mastermix 10.0 μL,最后加入4.0 μL DNA模板,总体积20 μL。每样品设一个平行反应,并设置阴性对照与空白对照。反应程序为:94 ℃预变性5 min; 94 ℃变性30 s,54 ℃退火40 s,72 ℃延伸60 s,40个循环;72 ℃延伸7 min。   实时荧光PCR扩增结束后在ABI Prism 7000中观察并记录结果;普通PCR扩增反应结束后,PCR扩增产物以1.5%琼脂糖凝胶电泳检测,在GelDoc-EQ(Bio-Rad)凝胶成像系统上观察并记录结果。   2 结果与分析   2.1 3种方法提取含10.0%玉米的茶叶样品基因组DNA浓度和纯度   由表1可知,试剂盒法提取的基因组DNA浓度较低,纯度与另外两种方法相差不大,改良CTAB法提取的基因组DNA的浓度和纯度比标准CTAB法提取的基因组DNA的浓度和纯度都要高,但相差不大。   2.2 茶叶样品普通PCR和实时荧光PCR扩增结果   3种提取方式都有清晰而明显的扩增条带,其中标准CTAB法得到的基因组DN

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