培训课件-遗传标记基因图谱.ppt

* 厘摩（centimorgan，简写为cM），或称为图距单位（map unit），是连锁遗传中的距离单位，以现代遗传学之父托马斯·亨特·摩尔根的名字命名。 1厘摩的定义为两个位点间平均100次减数分裂发生1次遗传重组。 * 因为人类基因组有24种不同的染色体（23种常染色体和X、Y染色体），所以完整的人类基因组图谱应该是24种以线性结构形成存在的DNA大分子物理图谱。 * 在游离染色质上的荧光原位杂交：用碱性溶胞剂对处于G1和G2期之间的间期细胞核进行处理，释放出游离的染色质丝，这种染色质丝已经失去了原有的细胞空间结构，其DNA的浓缩度更进一步降低。 在DNA纤维上的荧光原位杂交：用更强的变性剂对染色质丝进行处理，让DNA分子完全从蛋白质中分离出来，制备出DNA纤维 在间期细胞核上的荧光原位杂交：在制备染色体切片时，很容易得到大量的间期细胞核。这些细胞核没有典型的染色体结构，但其染色质在这一时期却比分裂时期的染色体浓缩程度低很多，荧光原位杂交的分辨率也会比染色体高很多。Lawrence等首先观察到两个DNA探针的实际距离与间期细胞核上的荧光原位杂交信号的距离具有一定的关系。 在减数分裂粗线期染色体上的荧光原位杂交：这一时期的染色体已经完成了同源染色体的配对，利用特殊的制片技术，可以分离到单条染色体，其长度通常比相应的中期染色体长10-20倍。并且这一时期染色体的形态也十分特殊，着丝点和端粒结构很容易识别，并且每条染色体的异染色质和同染色质区都有可识别的结构特征。 第二节 基因图谱 遗传图谱 物理图谱 转录图 序列图 第二节 基因图谱 遗传图谱：又称连锁图谱。指人类基因组内基因以及专一的多态性DNA 标记位置的图谱。表示同一条染色体的任意两点的相对距离和位置关系，因此遗传图谱只能显示标记的相对距离，长度单位用厘摩(centimorgan, cM)表示，1cM平均相当于100万个碱基对。 遗传图谱的理论依据 （1）基因在染色体上是呈直线排列的； （2）非等位基因在染色体上排列的直线距离与基因间的重组频率呈正相关。 遗传连锁图谱的构建步骤 （1）选用合适的分子标记 （2）选择用于建立作图群体的亲本组合 （3）建立作图分离群体 （4）测定作图群体中不同个体或者株系的标记基因型 （5）对标记基因型数据进行连锁分析，构建标记连锁图 （5）对标记基因型数据进行连锁分析，构建标记连锁图 设计大量的已知连锁基因个体的杂交试验； 获得的F1再同纯隐性个体测交计算重组频率； 以重组频率的1%作为1个摩尔根单位（即1cM）将基因定位在一条直线上。 个体表型性状组合类型 个体数量 ① ec + + 810 ② + sc cv 828 ③ ec sc + 62 ④ + + cv 88 ⑤ + sc + 89 ⑥ ec + cv 103 杂交：♀ec++/ec++ × ♂+sccv/Y ♀ec++/+sccv ♂ec++/Y 测交：♀ec++/+sccv×♂ecsccv/Y ↓ ↓ 根据这些数据和重组频率公式可计算出每两个基因之间的互换值： 以重组频率的1％作为1摩尔单位就可以将三个基因定位。三个基因的线性关系排列如下： 9.7% 7.6% 17.3% cv ec sc 例2：在例1中的F1测交后代出现6种表型后代，而在有些连