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(七)多肽合成后的定向输送及转译后加工 * 二 . 蛋白质的合成过程(大肠杆菌) 氨基酸的活化 肽链合成的起始 肽链的延伸 肽链合成的终止与释放 蛋白质合成的机制要比DNA复制和转录复杂的多。它大约需要300多种生物大分子,其中包括三类核糖核酸、可溶性蛋白质因子等参加的协同作用。其合成过程大致分为5个阶段:氨基酸的激活、肽链合成的启动、肽链的延长、肽链合成的终止和释放、肽链的折叠和加工处理。 (一)氨基酸的活化与转运 氨基酸在掺入肽链之前必须活化(activition)以获得额外的能量。活化反应是在氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase)催化下进行的。活化了的氨基酸与tRNA形成氨酰-tRNA。这一反应可在可溶性细胞质内完成。活化反应分两步进行: 1、氨基酸-AMP-酶复合物的形成:反应如下: ATP+氨基酸+酶——→氨基酸-AMP-酶+PPi 反应需要Mg2+或Mn2+,并且是ATP水解释放能量供复合物的形成。在复合物中,氨基酸的羧基通过酸酐键与AMP上的5’-磷酸基相连接,形成高能酸酐键,从而使氨基酸的羧基得到活化。 2、氨基酸从复合物上面转移到相应的tRNA上面: 氨基酸-AMP-酶+PPi ——→氨酰-tRNA+AMP+酶 1、 活化 : AA-AMP-E复合物的形成 E-CR1-C-O ~P-O- CH2 = O OH - O 腺嘌呤 OH OH O NH2 AA+ATP+E AA-AMP-E +PPi Mg 2+ Mn 2+ 2、 转移 AA-AMP-E+ tRNA 氨酰-tRNA +AMP+E P P P C C A 高能酸苷键 O C-C-R O H NH3 + OH 2?-OH连接AA,影响下一步 肽键形成 氨基酸活化的总反应式是: 氨基酸+ATP+tRNA +H2O ??氨酰-tRNA+AMP+PPi 20种氨基酸中每一种都有各自特异的氨酰-tRNA合成酶。氨酰-tRNA合成酶具有高度的专一性,它既能识别相应的氨基酸(L-构型),又能识别与此氨基酸相对应的一个或多个tRNA 分子;即使AA识别出现错误,此酶具有水解功能,可以将其水解掉。这种高度的专一性保证了氨基酸与其特定的tRNA准确匹配,从而使蛋白质的合成具有一定的保真性。 氨酰-tRNA 合成酶 tRNAIle——携带Ile的tRNA Ile- tRNAIle——异亮氨酰-tRNAIle 氨酰-tRNA合成酶和之相对应的tRNA分子被称为遗传密码第二重要性 (二)大肠杆菌中肽链合成的起始 1、起始密码子(起始信号):细菌中多肽的合成并不是从mRNA5’端的第一个核苷酸开始的。被转译的头一个密码子往往位于5’端的第25个核苷酸以后。mRNA上的起始密码子常为AUG,少数情形下也为GUG。 对起始密码子附近的核苷酸序列进行分析后发现,在距离起始密码子上游约10个核苷酸的地方往往有一段富含嘌呤的序列(称为Shine-Dalgarno序列,简称SD序列)。它与16SrRNA3’端的核苷酸序列形成互补。 下图为一些原和生物的SD序列和SD序列于16SrRNA3’端片段之间的互补关系: 现在已经知道作为多肽合成起始信号的密码子有两个,即甲硫氨酸的密码子(AUG)和缬氨酸的密码子(GUG)(极少出现)。在大肠杆菌中, 起始密码子AUG 所编码的氨基酸并不是甲硫氨酸本身, 而是甲酰甲硫氨酸。 fMet-tRNAf的形成 Met-tRNAf + N10-甲酰FH4 fMet-tRNAf + FH4 甲酰化酶 真核生物:Met-tRNAMet。真核生物无甲基化过程,起始氨基酸是Met,起始tRNA为Met-tRNAMet fMet-tRNAifMet 2、起始复合物的形成:原核细胞中的起始氨基酸是甲酰甲硫氨酸,而不是甲硫氨酸,它是在甲酰化酶作用下形成的。但需注意的是这种酶只能催化甲硫氨酸-tRNAf转化为甲酰甲硫氨酸-tRNA(fMet-tRNA),而不能催化游离的甲硫氨酸或Met-tRNAm的甲酰化。这就是说细胞内有两种携带甲硫氨酸的tRNA。即tRNAf用来与fMet相结合,参与原核生物肽链的合成的起始;而tRNAm携带正常的甲硫氨酸掺入肽链。 起始复合物的形成可分三个步骤进行:首先始30S的亚基与起始因子3(IF3)结合以阻止30亚基与50S亚基重新结合;然后30S亚基与mRNA结合成 30S·mRNA·IF3复合物(组分比例1:1:1)。第二步是30S·mRNA·IF3与已经含有结合态GTP及甲
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