蛋白质序列可视化.docVIP

生物信息学是一个较新的学科领域,它涵概了对基因组信息的多个研究过程,通过综合运用生物学、信息学、统计学、数学等工具和手段,来阐明和理解生物数据,使之成为具有明确生物意义的生物信息,并通过对生物信息的查询、检索、比较和分析,从中获取基因编码、基因调控、核酸和蛋白质结构功能及其相互关系。蛋白质是生命体赖以生存的营养要素，是细胞组织的重要组成部分，几乎所有的生物过程都与蛋白质发生某种联系。根据蛋白质序列的排列顺序和序列信息确定蛋白质的功能成为生物学研究重点。它的主要研究方法可分为两大类，其一是利用实际实验的方法来预测，包括X光绕射和核磁共振；其二则是利用理论计算的方法，包括同源建模法、折叠识别法以及从头预测法三种。虽然用实验的方法较为准确，但花费的时间长，而且很多蛋白质难以结晶，因而实验结果也受到技术和设备上的制约；相对而言，用理论计算的方法则可以避免这些缺点，所以发展基于蛋白质序列对结构和功能进行预测的模型成为必要。 由于生物数据的复杂性和高维性，既不能以数字公式表示，也不能以逻辑公式表示，故对这些序列的研究大多是基于统计工具。此外，通过数据的可视化，帮助人们认识和理解生物序列，进而分析和解释数据，使人们从表面上看来是杂乱无章的海量数据中找出隐藏的规律，为科学发现提供依据。所以，现在有些学者开始借助各种可视化工具，以图、树、方体、链的形式展现其复杂结构和序列模式，以求直观地表达生物序