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第七章 原核生物基因表达调控
第一节 基因表达调控的基本概念
1.反式作用因子和顺式作用元件。基因产物(蛋白质或RNA)从合成的场所扩散到目标场所而发挥作用的过程称为反式作用(trans-acting),基因产物被称为反式作用因子(trans-acting factor) 。反式作用因子的编码基因与其识别的或结合的靶核苷酸序列一般相距较远,或者位于不同的DNA分子上。顺式作用元件(cis-acting factor)是指对基因表达有调节活性的DNA序列,其活性只影响与其自身同处在一个DNA分子上的基因;同时这种DNA序列通常不编码蛋白质,多位于基因旁侧或内含子中。顺式作用(cis-acting)的概念用于任一不转变为任何其他形式的DNA序列,它只在原位发挥DNA序列的作用,仅影响与其物理上相连的DNA。基因活性的调控主要通过反式作用因子(通常是蛋白质)和顺式作用元件(通常在DNA上)相互作用而实现。
2. 结构基因和调节基因。结构基因(structural gene)是编码蛋白质或RNA的任何基因。结构基因编码大量的功能各异的蛋白质,如组成细胞和组织的结构蛋白和酶等。调节基因(regulator gene)是参与其他基因表达调控的RNA和蛋白质的编码基因。调节基因编码的调节物通过与DNA上的特定位点结合而控制受调节基因的转录是基因表达调控的关键。
3. 启动子和终止子。位于转录单位开始和结束位置上的DNA序列,称为启动子(promoter)和终止子(terminator)。两者都是典型的顺式作用元件,能受同一类反式作用因子RNA聚合酶的识别。
4.操纵基因和阻抑蛋白。操纵基因(operator)是与启动子相邻的顺式作用位点,是阻抑蛋白的靶点。阻抑蛋白(repressor)可以阻止受调节基因的表达。当阻抑蛋白与操纵基因结合时,就会阻止RNA聚合酶启动转录,基因的表达就被关闭。在无阻抑蛋白时,RNA聚合酶可以识别受调节基因的启动子,使这种基因得到表达。
5. 转录因子。转录因子(transcription factor )是转录起始过程中RNA聚合酶所需要的辅助因子。转录因子是参与正调控的反式作用因子,在无转录因子时,RNA聚合酶不能起始转录。转录因子通常识别位于基因上游启动子附近的顺式作用元件。
第二节 转录水平的调控-操纵子。 原核生物许多功能相关的结构基因,特别是编码同一代谢途径的酶的基因,一般成簇排列,能受单一启动子的共同控制,结果是整簇基因或者都表达或者都不表达。原核生物的基因调控可以发生在转录和翻译等不同阶段,但也是以转录水平为主。操纵子(operon)就是由操纵基因(operator)以及相邻的若干结构基因所组成的功能单位。操纵子还包括一个结合RNA聚合酶的启动子。操纵基因是操纵子的前端部分,它能和阻抑蛋白结合,控制结构基因的转录。原核生物操纵子中的全部结构基因从同一个启动子开始转录成单个mRNA分子。操纵基因是顺式控制元件,阻抑蛋白是由调节基因表达出的蛋白质,是参与操纵子调节的反式作用因子。
一、乳糖操纵子的结构。乳糖操纵子(lactose operon,lac )的三个结构基因成簇排列,编码参与β-半乳糖苷(如乳糖)分解代谢所需的三种蛋白质:lacZ编码β-半乳糖苷酶,lacY编码β-半乳糖苷透性酶,lacA编码β-半乳糖苷转乙酰基酶。lacI基因正好与结构基因相邻,但它不与结构基因属于同一转录单位,它有自己独立的转录单位,含有自己的启动子和终止子。lacI编码可扩散的产物,理论上它不必位于结构基因附近。将lacI基因转移到其他任何地方都能很好地发挥作用,因此lacI的表达产物属于反式作用因子。lacI基因的表达产物称为乳糖操纵子阻抑蛋白(lac repressor)。它的功能是阻止结构基因的表达。因此,乳糖操纵子的调控属于负调控。阻抑蛋白与lacZYA基因簇开始处的操纵基因(O lac)结合,阻止RNA聚合酶在启动子的转录起始而发挥作用。
二、色氨酸操纵子。乳糖操纵子阻抑蛋白仅作用于lacZYA基因簇的操纵基因,而一些阻抑蛋白通过结合多个操纵基因控制散在分布的结构基因。主要的例子是色氨酸阻抑蛋白,它控制三套不相连的基因。第一套基因是结构基因簇tryEDBCA,控制从分支酸(chorismic acid)合成色氨酸的酶的合成。第二套是aroH基因,aroH基因编码在芳香族氨基酸生物合成共同通路中催化起始反应的三种酶中的一种。第三套基因是trpR调节基因,trpR调节基因被自身产物Trp阻抑,阻抑会降低自身的合成。Trp操纵基因序列长21bp,三个基因座位上均有一个该序列,是trp阻抑蛋白的作用位点。
三、小分子诱导物对阻抑蛋白活性的影响。细菌应答某种特定物质出现而合成特定酶的过程,称为诱导作用(ind
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