第一章 遗传的物质基础.ppt

Initiation Execution He, L. and G. J. Hannon (2004). Nat Rev Genet 5(7): 522-3 4）miRNA 的保守性 miRNA 的保守性非常显著。保守性与其功能的重要性有着密切关系, 同时也为生物早期进化的同源性提供了证据； The conservation of plant miRNAs Application of RNAi Biological research Defining gene function (gene knockout ) Defining biochemical pathways Therapeutic treatment Cancer Viral infection Gene “knock down” in model systems Zamore, P. D. (2002). Science 296(5571): 1265-9. Couzin, J. (2002). Science 298(5602): 2296-7. 5）关于miRNA 的讨论和展望 miRNA为什么选择21nt左右的长度？ 21nt可能是mRNA 表达所需的最小热力学稳定长度； 21nt的排列组合可以满足其所要调控的基因数量, 而不会浪费； 将70nt 的前体加工为21nt的miRNA , 其速度要比从mRNA 转录到蛋白质翻译调控的全过程快得多,因此能更加迅速地调控基因表达； 转录的长度越短, 转录时的出错率也就越小, 对调控过程更为有效。 miRNA和siRNA 的进化关系 两者加工和表达机制相似, 可能都是早期RNA 在进化上的遗留物, 后来逐步被蛋白质调控所代替； 类似于siRNA 的调控机制可能出现得更早, 可能是早期基因调控的主要方式； 在进化过程中可能逐步产生miRNA 来代替它, 使miRNA 成为发挥调控作用的主导因子。 原核生物与真核生物rRNA基因排列方式 总RNA电泳检测 （A）甲醛变性琼脂糖凝胶电泳图谱 (B) 烟草总RNA普通琼脂糖凝胶电泳图谱 总RNA制备 3、信使RNA(messenger RNA，mRNA) nascent RNA: an RNA whose synthesis has not yet been completed. Monocistronic: mRNAs represent only a single gene. Polycistronic: sequences coding for several proteins. Coding region consists of a series of codons representing the amino acid sequence of the protein, starting (usually) with AUG and ending with a termination codon. Leader: An additional sequence at the 5′end, preceding the start of the coding region. Trailer: An additional sequence following the termination signal, forming the 3′end. 原核生物基因的转录 原核生物mRNA的转录和翻译发生在同一细胞空间，而且两个过程几乎同时发生； 真核生物是在核内转录，细胞质内翻译。 原核生物mRNA的特征 半衰期短：仅几分钟； 原核生物mRNA多为多顺反子（操纵子）形式； 结构：前导序列(leader)、编码区、尾巴(trailer) 通常以AUG为起始密码子，有时是GUG或UUG 在AUG上游7-12个核苷酸处有一5’AGGAGG3’ 序列，称SD顺序( Shine-Dalgarno Sequence)。这段序列与16S rRNA 3’末端反向互补，与mRNA和核糖体的结合相关，因此会影响蛋白质的翻译。 原核生物mRNA转录-翻译-降解 Overview: mRNA is transcribed, translated, and degraded simultaneously in bacteria. 原核生物mRNA结构 Bacterial mRNA includes non-translated as well as translated regions. Each coding region has its own initiation and termination signals. A typical mRNA may have