张扬基因芯片讲义.pptVIP

基因芯片及应用 内容简介 第一部分 芯片概述 第二部分 几种芯片的应用介绍 第三部分 不同芯片平台的介绍 第四部分 芯片实验中应该注意的问题 第五部分 定制芯片的一个案例介绍 生物芯片——研究基因组学的有力工具 What whole genome scanning for? 影响表观遗传学的重要因子 　　SNP的变化 　　基因组甲基化 　　基因拷贝数变化 　　插入，缺失．．．． 采用的技术 　　Affymetrix SNP系列芯片（SNP, CNVs) Agilent CGH系列芯片 　　Illumina　Hap 系列芯片 SNP与遗传突变 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)是指在基因组上单个核苷酸的变异,包括置换、颠换、缺失和插入。 在人类基因组中大概每300个碱基就有一个SNP 。 从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为2 :1。 SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的C 常为甲基化的,自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。 一般而言,大多数SNP对细胞功能无影响，但少数可以使人对疾病易感，或者对药物敏感。 为什么SNP会变化？ SNP和肺癌 4月3日《Nature》