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生物化学-质粒DNA测定实验报告.
实验名称
(Title of Experimetn) 质粒提取、定量与酶切鉴定(Date of Experiment) 2015-11-17 实验地点(Lab No.) 第四实验室 合作者(Partner) 指导老师(Instructor) 总分
(Total Score) XX 教师签名(Signature) 李某某 批改日期
(Date) 2013-06-03 【实验报告第一部分(预习报告内容):①实验原理、②实验材料(包括实验样品、主要试剂、主要仪器与器材)、③实验步骤(包括实验流程、操作步骤和注意事项);评分(满分30分):XX】
1.实验原理
质粒DNA定量测定-紫外光吸收法
A260/A280的比值可以反应DNA的纯度
Ratio= 1.8 DNA样品较纯,符合实验要求;
Ratio>1.9 RNA污染;
Ratio<1.6 蛋白质或其它杂质的污染;
4)质粒DNA的酶切鉴定
限制性核酸内切酶是一类能识别双链DNA分子特异性核酸序列的DNA水解酶,是体外剪切基因片段的重要工具酶,可分为型。其中,II型识别和切割的核苷酸序列专一限制性核酸内切酶识别序列,其识别位点长度为4~6个核苷酸的回文序列。本实验中用到的两种酶类:EcoRⅠ和HindⅢ就是II型限制性核酸内切酶,可将质粒DNA割成不用大小片段。不同质粒DNA有不同的核苷酸序列,因而其酶切位点和数量也不同。
琼脂糖凝胶电泳:琼脂糖是一种天然聚合长链状分子,可以形成具有刚性的滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度。DNA分子在碱性环境中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动.
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与分子筛效应。不同的DNA,分子量大小及构型不同,电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带。
迁移速率DNA>DNA>开环的双链环状DNA
2.实验材料
样品
2)试剂:
质粒提取试剂盒:溶液S1(细菌悬浮液)、裂解液S2、中和液S3、洗涤液W、洗脱液、RNase A(100mg/ml)、DNA吸附柱
Hind III核酸内切酶(TaKaRa)
电泳实验上样缓冲液
EcoR I核酸内切酶(TaKaRa)
10× M 酶切缓冲液:
蒸馏水
3)仪器:
1)碱裂解法提取质粒
2)质粒DNA定量测定
3)质粒DNA的酶切鉴定
在一个洁净的0.5 ml离心管中混匀下列反应物:
反应物
体积(μl)
10× M 酶切缓冲液
2
质粒DNA
500~1000ng (10 μl)
Hind III
1
EcoR I
1
H2O
至 20
混合后37 ℃水浴1~2h
琼脂糖凝胶电泳:制备
上样:加样前,样品先与6×上样缓冲液混匀。用加样器吸取样品,轻轻的加入到凝胶的样品孔中,加样量为6 μl
盖上电泳槽,接通电源,开始电泳。电泳条件:电压80v;时间25~30分钟;
电泳结束后,切断电源,取出凝胶。
电泳结果分析:紫外检测仪直接观察电泳条带。取出凝胶,置于凝胶成像仪中观察结果,并拍照记录。
4.注意事项
1)碱裂解法提取质粒DNA
加入250μL裂解液S2不可过分用力振荡,避免染色体DNA因外力作用断裂成小片段,从而与质粒DNA混合在一起,引入误差。
2)紫外分光度法测定酶切质粒DNA
(1)拿UVette比色皿时,应注意拿着比色皿的粗糙面。最好在使用之前用干净的纸巾擦拭光学面。并且放比色皿时注意将光学面与出光方向一致。空白对照和样品应该在同一个比色皿中检测,以防误差。
(2)在比色皿中稀释时,要用加样枪充分混匀并防止气泡和其他悬浮物的出现。
(3)在酶切反应体系中,质粒DNA最后加入,以防止操作不当引起的试剂的污染,而且在混合后避免强烈振荡,保证不使内切酶变性及DNA分子的完整。
3)质粒DNA的酶切分析
(1)因为缓冲液具有致癌性,所以在混合缓冲液是一定到戴手套操作。若不慎沾到要立即用大量清水冲洗。
(2)离心管中混匀物质时,HindIIIEcoRI应最后加入。3)水浴时应把管盖盖紧,避免水蒸气进入。 【实验报告第二部分(实验记录):①主要实验条件(如材料的来源、质量;试剂的规格、用量、浓度;实验时间、操作要点中的技巧、失误等,以便总结实验时进行核对和作为查找成败原因的参考依据);②实验中观察到的现象(如加入试剂后溶液颜色的变化);③原始实验数据。评分(满分20分):XX】
1.实验条件
1)材料:实验室提供
2试剂:规格用量严格按照操作步骤中要
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