生综考试终极版资料..doc

生综一： 基于BLAST序列比对的未知基因功能分析： 1、利用其他字母掩盖低复杂序列区域，防止假阳性的产生。 2、对查询序列作如下处理： （1）给定单词（word）长度w（一般蛋白质为3，核酸为11）和打分矩阵，将长度为n的查询序列从第一位到最后一位拿到n-w+1个单词 （2）创建一个单词列表，其中的单词为经与上述单词比对打分后分数高于T的长度为w的单词。 （3）单词表中的单词称为种子(seed),将单词表中的每一个单词在所有的数据库序列中找到其出现的每一个位置 3、用动态规划的方法沿左右两个方向延伸种子直到打分不低于某一个临界分值（允许暂时低于该值）。得到的结果称为高分片段对（high-scoring segment pair, HSP）。 4、BLAST算法得到的结果的统计显著性分析：计算E-value。它指对一个给定的打分值在随机情况下在数据库中搜索比对的结果数目的期望。 结果：E值：越低越好； 序列比对得分Score: 越高越好； 高得分片段的相似度Identity：越高越好。 同源建模步骤及应用 SWISS-model：同源建模方法预测蛋白质结构。一般由四步完成。 1。 从待测蛋白质序列出发，搜索蛋白质结构数据库（如PDB，SWISS-PROT等）， 得到许多相似序 列（同源序列），选定其中一个（或几个）作为待测蛋白质序列的模板； 2。 待测蛋白质序列与选定的模板进行再次比对，插入各种可能的空位使两者的保守位置尽量对齐； 3。 建模：调整待测蛋白序列中主链各个原子的位置，产生与模板相同或相似的空间结构——待测 蛋白质空间结构模型； 4。 利用能量最小化原理，使待测蛋白质侧链基团处于能量最小的位置。 动力学模拟在蛋白质结构分析中的应用 （1）蛋白折叠研究；（2）酶催化反应机理研究；（3）蛋白结构与功能关系研究 （4）蛋白模型优化；（5）配体-受体诱导契合研究；（6）自由能计算研究 转录因子（核受体）的调控 细胞核内，核受体通过三种基本的作用模式调节基因转录：1，核受体与其伴侣转录因子的二聚体受到其配体亲脂性小分子激活后结合至靶DNA的靶序列从而调节转录；2，该二聚体受到配体激活后招募其他转录因子，通过其他转录因子与靶DNA的靶序列结合调节转录；3，该二聚体受到细胞表面受体或CDK蛋白激酶的激活而与靶DNA的靶序列结合调节转录。此外，最新研究发现核受体能够与胞浆蛋白发生相互作用，提示其可能具有转录因子之外的功能。 细胞周期研究策略和方法： 有丝分裂摇落法：得到M期细胞 化学同步法：DNA合成阻断，同步于S期；中期阻断法，同步于M期。 免疫组化、western blot：检测参与细胞周期调控的蛋白质 Brdu掺入实验：鉴别S-期细胞 显微注射：（在高倍倒置显微镜下，利用显微操作器（Micromanipulator），控制显微注射针在显微镜视野内移动的机械装置，用来进行细胞或早期胚胎操作的一种方法） 细胞融合：细胞核和细胞质对细胞周期进程的影响 细胞凋亡的研究方法和策略： 形态学检测：染色（HE染色、吖啶橙荧光染色、细胞骨架染色）、光镜观察、扫描电镜观察、投射电镜观察。 DNA琼脂糖凝胶电泳（琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。其分析原理与其他支持物电泳最主要区别是：它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。） tunel technique（DNA原位末端标记-tunel法染色） 彗星电泳（包括测定DNA双链断裂的中性单细胞凝胶电泳技术和测定DNA单链断裂的碱性单细胞凝胶电泳技术） 流式细胞检测（是一种在功能水平上对单细胞或其他生物粒子进行定量分析和分选的检测手段，它可以高速分析上万个细胞，并能同时从一个细胞中测得多个参数，与传统的荧光镜检查相比，具有速度快、精度高、准确性好等优点，成为当代最先进的细胞定量分析技术） 生综二： 模式形式：各种类型细胞并非无序排列，而是按照一定的空间模式排列。 原肠胚形成：原肠胚形成是由囊胚细胞迁移、转变形成的，它由三层细胞层构成：外胚层(ectoderm)、中胚层(mesoderm)、内胚层(endoderm)。在囊胚不断向内凹陷的过程中，形成外、中、内三个胚层，内胚层中间的空间是原肠腔。外胚层和内胚层最终形成组织的鞘，即上皮(epithelia),覆盖在器官的外表面和内表面。原肠胚外胚层发育成神经系统,感觉器官,表皮及其附属结构;中胚层发育成骨骼,肌肉,循环,排泄,生殖系统等;内胚层发育成肝,胰等腺体,呼吸道,消化道的上皮。胚胎由囊胚继续发育，由原始的单胚层细胞发展成具有双层或三层胚层结构的胚胎，称为原肠胚（或神经胚）。 程序性死亡：又名细胞凋亡，是一个主动的由基因决定的自动结束生命的过程。具体指细胞遇到内、外环境因子刺激时，受基因调控启动的自