2DNA的结构例析.ppt

DNA的结构 第一节 遗传物质的本质 第二节 核酸的化学组成 第三节 DNA的二级结构 第四节 DNA的物理化学性质 第五节 超螺旋和拓扑异构 第一节 遗传物质的本质 朊病毒致病机理 ①朊病毒蛋白有两种构象：细胞型（正常型PrPc）和搔痒型（致病型PrPsc）。两者的主要区别在于其空间构象上的差异。PrPc仅存在a螺旋，而PrPsc有多个β折叠存在，后者溶解度低，且抗蛋白酶解； ②Prpsc可胁迫PrPc转化为Prpsc，实现自我复制，并产生病理效应； ③基因突变可导致细胞型PrPsc中的α螺旋结构不稳定，至一定量时产生自发性转化，β片层增加，最终变为Prpsc型，并通过多米诺效应倍增致病。 第二节 核酸的化学组成 第二节 DNA的二级结构 第四节 DNA的物理、化学性质 第五节 超螺旋和拓扑异构 D.S DNA S.S DNA Denaturation ▲ ▼ Renaturation 复性过程依赖于单链分子间的随机碰撞 ( Depends on the collision of complementary S.S. DNA ) 二、DNA分子的复性 （anneal or renaturation） 概念：变性DNA在适当条件下，两条彼此分开的链又可以 重新地合成双螺旋结构的过程（退火） 1、 影响DNA复性过程的因素 ： ? 阳离子浓度 0.18 ~ 0.2M Na+ 可消除polydNt 间的静电斥力 复性反应的温度 低于Tm值 25℃左右 (60-65℃) ? S.S, DNA 的初始浓度 C0 ? DNA 分子中, dNt 的排列状况 (随机排列, 重复排列) ? S.S. DNA分子的长度（片段的大小） S.S. DNA愈长 S.S. DNA愈短 → 分子扩散愈慢 → 复性愈慢 → 分子扩散愈快 → 复性愈快 3’-ATCTATGCTGTCAT-5’ 5‘-TAGATACGACAGTA-3’ 5‘-TAGATACGACAGTA-3’ 3’-ATCTATGCTGTCAT-5’ 3’-ATATATATATAT-5’ 5‘-TATATATATATA-3’ 3’-ATATATATATAT-5’ 5‘-TATATATATATA-3’ 5‘-TATATATATATA-3’ 3’-ATATATATATAT-5’ 3’-ATATATATATAT-5’ 5‘-TATATATATATA-3’ 上节课内容回顾: 1、DNA的不寻常结构： 三螺旋DNA 四链DNA 2、第四节 DNA的物理化学性质 变性：溶解曲线 Tm 影响因素（GC、化学试剂、 盐、pH） 复性 一、超螺旋（superhelix OR supercoil） ●?最早在SV40和多瘤病毒 中发现 ● 超螺旋是所有线性或环 形DNA的共有的重要特征 The supercoils of the SV40 minichromosome can be relaxed to generate a circular structure, whose loss of histones then generates supercoils in the free DNA. 1、 超螺旋结构的方向性 B-DNA 紧缠overwinding (右旋) 正超螺旋（positive supercoiled ） 导致左手超螺旋 以一根绳子做实验： 原来的绳子的两股以右旋方向缠绕；在绳子的一端向紧缠方向捻转，再将绳子的两端连接起来，则产生一个左旋的超螺旋以解除外加捻转的协变 Twist 36° ? 大、小沟的差异 ⊕ 大沟中碱基差异容易识别 ，往往是蛋 白质因子结合特异DAN序列的位点 ⊕ 小沟相对体现的信息较少 二、 影响双螺旋结构稳定性的因素 l?????? 氢键 (Hydrogen bond 4~6 kc / mol) 消除DNA单链上磷酸基团间的静电斥力 弱键, 可加热解链 氢键堆积, 有序排列(线性, 方向)? l?????? 磷酸酯键 (phosphoester bond 80~90 kc / m