基因芯片与sky要点.ppt

东莞市产前诊断中心成立于2011年3月，目前36人 博士学位1人，硕士12人，正高级6人，副高级6人 国家卫计委批准的首批产前高通量测序试点单位 东莞市胎儿21-三体综合征无创产前检测定点单位 耳聋基因筛查和高危孕妇产前诊断的定点单位 东莞市地中海贫血防控的技术指导单位和培训单位 东莞市出生缺陷防控指导和培训单位 东莞市产前诊断中心简介 承担各类各级科研课题10余项，总资助金额近200万元 续 近5年发表论文20余篇，其中SCI收录12篇 续 TUPLE1和ARSA的FISI结果两红两绿，代表正常二倍体，无缺失 实例：先证者为一例新生儿，其父母双亲表型和智力未见异常 基因芯片基本原理 Array-CGH图谱中， 发现两处CNVs异常：1p36.33和1q21.3 Array-CGH 分析 基因芯片基本原理 CMV临床应用 提高检出几率 临床指导规范 临床应用指证 科学研究方向 ⒈提高检出几率 基因芯片临床应用 引用：东莞市妇幼保健院产前诊断中心 提示： 常规染色体核型分析正常的产前样本中，采用aCGH技术检出15例异常，异常率约为6.5% 基因芯片临床应用 基因芯片临床应用 基因芯片临床应用 （B7798） （B373） 引用：医学遗传学国家重点实验室病例材料 基因芯片临床应用 先证者 儿子 Chr12pppppp=11Mb 重复 儿子 提示： 采用 SNP Mapping 100K Array 全基因组拷贝数检测，查明12号染色体短臂重复11Mb 染色体新发相互易位产前诊断 孕妇为46,XX,t(1;17)，一次不良妊娠史，胎儿存在t(1;17)和t(3;18)，夫妻希望生育此胎儿，经SNP array检测发现了13处拷贝数改变，经查阅数据库，不支持致病，后生育一健康小孩。 2012年2月复诊照片 基因芯片临床应用 ⒉临床指导规范 基因芯片临床应用 美国遗传协会 ACOG 2009 基因芯片临床应用 加拿大遗传协会 CCMG 2010 基因芯片临床应用 基因芯片临床应用 ⒊应用指证 序号 产前（胎儿） 产后（包括成人） 1 影像学检查异常 原发性智力低下 2 大龄孕妇 生长发育迟缓 3 产前筛查高危 自闭症 4 具有遗传自亲代的平衡易位，但胎儿发育异常 多发畸形/特殊面容 5 G显带新发平衡易位 新发染色体平衡易位 6 不良孕产史 遗传自表型正常的亲代 7 其他 不孕症/反复流产 基因芯片临床应用 ⑴.aCGH在原发性智力低下原因分析中的临床应用 基因芯片临床应用 续表 基因芯片临床应用 ⑵.aCGH在产前诊断中的应用 基因芯片临床应用 应用aCGH进行临床检测的注意事项 CMA国际应用指南总结（1） CMA产前诊断临床适应症 产前超声或磁共振（MRI）检查提示胎儿结构异常：推荐CMA技术替代染色体核型分析作为一线检测方法 胎儿核型为遗传自亲代或为新发平衡重组且表型异常：推荐CMA进一步检测 胎儿核型无法明确诊断的染色体：推荐CMA技术进一步检测。这种情况包括衍生染色体、标记染色体等，通过CMA检测可帮助明确异常片段的来源和性质 无明确超声结构异常但接受产前诊断的胎儿样本：CMA和核型分析可任选其一 这种情况包括孕妇高龄、血清学筛查阳性、孕妇焦虑、不良生育史、染色体异常家族史、超声软指标阳性等 ⑤ 胎死宫内及死产：推荐CMA技术检测（如羊水、胎盘和流产物）以提高检出率 基因芯片临床应用 CMA国际应用指南总结（2） 检测前咨询及知情同意 检测前，应该由经专业培训及具相应资质的临床遗传医师对孕妇及家属做检测前遗传咨询，充分告知CMA检测的优势、局限性和可能的结果等，并签署知情同意，对产前CMA检测非常必要 ① 优势：能检出所有引起基因组不平衡改变的染色体异常，包括所有核型分析可检出的变异和无法检出的微缺/重复 ② 局限性： 无法检测平衡染色体重组（漏诊率0.6%）、10%嵌合体 、某些标记染色体、单基因突变及DNA甲基化。若使用的是aCGH芯片还无法检测三倍体 可检出不明确CNV（VOUS）：这时需对父母做检测，通过家系分析，以协助对胎儿检测判读。但多数情况下，基于目前对人类基因组的认识和数据库的积累程度，仍然无法对某些检测结果进行精确判读和解释 基因芯片临床应用 检出疾病的遗传异质性：所检出的某些遗传性疾病由于外显率和表现度的差异，在不同患者间临床表现可能存在很大的变异。 ④ 可能检出与临床表型不相关的CNVs：通过CMA检测可能发现非亲生父亲、近亲婚配、迟发性的遗传病或成人期发病的遗传病（如肿瘤），这些结果应该让孕妇及家属