1安装r软件-biodiversity.docVIP

张金龙, 朱慧玲, 刘金刚, Gunter A. Fischer. 植物标本标签设计的原则及R程序包herblabel. 生物多样性, 2016, 24 (12): 1345–1352. /CN/10.17520/biods.2016230 附录1 herblabel程序包的安装、配置和使用 Appendix 1 Installation, configuration and using of herblabel herblabel 程序包既可单独使用, 也可通过 run_herblabel 脚本运行, 生成不同样式的标签。 run_herblabel 下的 R 脚本同时提供数据检查功能, 可有效减少标签中的错误。用户只需要在 模板中录入数据, 双击 run.bat 文件即可生成标签, 同时完成标本记录的备份和检查。 用 run_herblabel R 脚本运行 herblabel, 需要安装 1. R 软件, 2. Rtools 软件包, 3. openxlsx 程序包, 同时配制好启动路径。herblabel 程序包对中文字符的处理基于 GB18030 编码, 因此 操作系统最好为 Windows 7 或者以上。本文介绍如何在 Windows7 中安装和使用 herblabel 打 印标本标签。在 Windows 8 以及 Windows 10 的安装与 Windows7 类似。 1 安装 R 软件 R 软件下载的地址为: /bin/windows/base/, 请按照默认路径安装 R 软件。建议用户下载最新版的 R, 因为涉及到字符编码转换, R 版本不能低于 3.0.3。 图 1 R 软件 windows 版本下载页 Page 1 of 12 张金龙, 朱慧玲, 刘金刚, Gunter A. Fischer. 植物标本标签设计的原则及R程序包herblabel. 生物多样性, 2016, 24 (12): 1345–1352. /CN/10.17520/biods.2016230 图 2 R 软件 3.3.1 的登录界面 2 设置 Rscript 的启动路径 Rscript 是 R 软件的组件之一, 可以直接在控制台(console)运行 R 脚本。例如安装的 R 软件版本为 3.3.1, 则 Rscript.exe 所在的文件夹一般为C:\Program Files\R\R-3.3.1\bin;。要 运行 run.bat 批处理文件, 必须在系统路径中添加 Rscript.exe 的启动路径。 图 3 Rscript.exe 所在的位置 设置方法为: 右键点击我的电脑属性高级环境变量系统变量, 找到 Path, 点击 “编辑”。通常已经安装的一些软件会自动添加启动路径, 这些已经存在的项目不能删除, 否 则会影响相应软件的功能, 因此只能在原有的文件启动路径后面添加 Rscript.exe 的路径。 Page 2 of 12 张金龙, 朱慧玲, 刘金刚, Gunter A. Fischer. 植物标本标签设计的原则及R程序包herblabel. 生物多样性, 2016, 24 (12): 1345–1352. /CN/10.17520/biods.2016230 添加方法为: 拷贝;C:\Program Files\R\R-3.3.1\bin;C:\Program Files\R\R-3.3.1\bin\i386; (注意: 仅拷贝双引号里面的内容, 且依据 R 的版本不同, 需要更改相应的版本号, 并以 Rscript.exe 所在的真实路径为准)到 Path 的最后。注意首位的分号;必须保留。然后点确定。 图 4 点击“环境变量”Environmental Variables 设定系统变量 图 5 通过“系统变量”System variables Path 添加启动路径 Page 3 of 12 张金龙, 朱慧玲, 刘金刚, Gunter A. Fischer. 植物标本标签设计的原则及R程序包herblabel. 生物多样性, 2016, 24 (12): 1345–1352. /CN/10.17520/biods.2016230 图 6 在 Variable value 一栏的最后, 添加 Rscript.exe 的启动路径 3 安装 Rtools Rtools 是编写 R 程序包的工具软件, 含有读写 xlsx 文件所需的 unzip 和 zip 函数, 安装 时必须允许 Rtools 修改启动路径, 以便从控制台中调用 zip 等命令读写 Excel 模板, 其下载 地址为: /bin/windows/Rtools/。 图 7 Rtools 下载页面, 以未冻结(Frozen)的版本为准 Page