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上海交通大学医学院科学家讲科研邓子新DNA硫修饰发现的探索之旅
邓子新:DNA硫修饰发现的探索之旅及对生物学人才培养的启示 【字体:大 中 小】 时间:2010年1月21日 来源:中国教育网------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
科研实验室里的文化和精神,对学生获得学位后服务社会,以及对年轻教师的继续培训都有非常深远的影响。尤其是实验室精神文化的建设,不是短时间内就能够建设起来的,也不是投入一些研究经费就能够建立起来的,这需要一个长期持续的过程。
科研实验室里的文化和精神,对学生获得学位后服务社会,以及对年轻教师的继续培训都有非常深远的影响。尤其是实验室精神文化的建设,不是短时间内就能够建设起来的,也不是投入一些研究经费就能够建立起来的,这需要一个长期持续的过程。在探索科学新发现的过程中,我发现有一些核心的、对人才培养有着关键性作用的问题,所以我想就实验室中科学研究的一个范例,来谈一谈科研对生物学人才培养方面的启示。
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一、DNA上的磷硫酰化修饰:发现瞬间的反响和激动
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这项科研工作揭示了在DNA大分子上一种新的硫修饰,DNA作为一种重要的生物大分子,在细胞体内是一个超螺旋的结构。在基本的结构以外,DNA可以进行甲基化修饰,这是大家知道的。现在回顾一下,其实甲基化的修饰也只是一个简单的发现,但它却带来了生物学领域的一次革命,推动了基因的复制和翻译、基因表达的调节等许多方面的科学发现。而今天我要介绍的DNA硫修饰可以说是除了甲基化修饰以外,在DNA修饰领域又一个新的发现。这项发现源于我们研究团队十几年的工作,在研究结果发表后,引起了国内外科学界的广泛反响,并入选了《环球科学》2007全球十大科学新闻,Faculty? of? 1000? Biology重大进展、专家观点栏目。多个国际期刊及国际会议都引述了我们的研究,指出“这种DNA磷酸骨架结构发生改变的首次发现将引发出围绕硫元素掺入的机理和这种修饰的功能等一系列值得深思的科学问题”,“毫无疑问,这一发现打开了一扇全新的窗口,将大大激发人们对DNA大分子上众多新谜底的激情探索,而在此之前人们对这些谜面从不曾想过”。现在看来,这项发现所引起的反响和评价,实际上有许多是我没有预料到的,也让我觉得非常震撼。
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在这里,我并不是要详细介绍该项研究,或让大家看到我们这个发现有多么重要,我是想以此为一个引子来谈一谈这项科研活动对我的启发、对教学和科研实践的启示,以及对今后生物学人才培养是否会有一些值得借鉴的经验,这才是我想与大家探讨的。
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二、瞬间激动的背后是二十年的挫折和坎坷
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如果说2007年底对于我的研究团队来说是一个瞬间的激动的话,那么在这个激动的背后也确确实实有许多的酸甜苦辣,现在回想起来反而是这些酸甜苦辣更值得我“眉飞色舞”,因为它们更多地反映了整个团队的挫折和坎坷,也才会产生值得我们借鉴的关键点,因此在谈启示之前,我想简单地介绍一下发现背后的故事。
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DNA上的磷硫酰化修饰这一科研发现,大致经历了以下几个科研历程:①DNA降解现象的不同解读;②DNA降解原因的层层排查;③“一种异常修饰”的遗传证据;④分离DNA修饰相关基因的挫折和尴尬;⑤硫元素可能掺入到了DNA中;⑥DNA硫修饰的化学本质--右旋磷硫酰化;⑦DNA磷硫酰化修饰广泛存在于细菌中。? 最初的研究就是起始于一个简单的现象--DNA降解,这种现象几乎每一个实验室每天都会发现,但是成百上千篇的文献都是做的同样一个解释,甚至已经成为一个习以为常、司空见惯的现象了。我们在实验中却发现,即使是在同样一种研究里,同样一个人提取的DNA,为什么从这种生物里提取的DNA不降解,而从另外一种生物里提取出来的DNA却会降解,由此我们就开始了大量的排查工作。以此开始,不断有了新的发现,但同时又开始提出了新的问题,从外在污染的排除,到解释该现象与甲基化修饰的关系,又到DNA中新元素的发现,直至最后确认这是一种新的生理修饰机制。现在,我们已经发现这种DNA硫修饰广泛存在于微生物中,是微生物一种普遍的生理现象,由此开始了一个新领域的诞生和展望。
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这么长时间的科研探索,其实起始于一个较为偶然的因素,在我们当初选择该项研究工作时,谁也没有从它生物学的重要意义、甚至是未来的轰动效益去考虑,我们就是本着把科研现象的解释做深、做透、做扎实、做系统的原则,才有了现在的成果。
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三、科学探索历程之外的启示
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在科学探索历程中,可能有许多东西是值得追寻、值得回味的。在我们发表论文或
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