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分子生物学-蛋白质
Please be quiet, 上课了! 同学们,早上好! 分子生物学 张晓军 第四章 蛋白质(protein) 第一节 蛋白质概述 一、 化学组成 C、H、O、N、S、P、Fe、Zn、Cu 二、蛋白质分类 1、从结构单位分 简单蛋白质:氨基酸 结合蛋白质:氨基酸+辅基 2、根据所带电荷 碱性蛋白:带正电荷(—N+H 3 ) 如:组蛋白 酸性蛋白:带负电荷(—COO-) 如:非组蛋 白 二、蛋白质分类 3、从空间结构 3.1 纤维状蛋白质 在生物体内,作为结构成分而存在 例如:胶原蛋白、角蛋白、丝蛋白 3.2 球状蛋白质 在细胞内承担动态的功能,即起酶学和 调节的作用 例如:酶 第二节 氨基酸 除甘氨酸和脯氨酸外,其他均具有如下结构通式: 甘氨酸 脯氨酸(亚氨酸) H2 C H2C CH2 HN——CH——COOH 二、氨基酸的分类 脂肪族氨基酸 脂肪族氨基酸 脂肪族氨基酸 第三节 蛋白质结构的层次体系 蛋白质分子是由氨基酸首尾相连而成的共价多肽链,但是天然的蛋白质分子并不是走向随机的松散肽链。每一种蛋白质都有自己特有的空间结构或三维结构,被称谓蛋白质的构象。 一个给定的蛋白质理论上可采取多种构象,但在生理条件下,只有一种或很少几种在能量上有利的。指导蛋白质多肽链折叠成能量上有利的构象的规律至今仍不完全清楚,寻找这些规律是当前奋力研究的课题之一。 蛋白质的结构就像一座精美的建筑, 层次丰富, 构造多彩 一级结构:多肽链中氨基酸顺序 共价键 含有复杂机构的全部信息 二级结构:ɑ-螺旋、B-折叠 非共价力(氢键) 三级结构:球状构象 非共价力(氢键、二硫键、疏水力) 四级结构:各亚基之间在空间上 的相互关系和结合方式 非共价力(氢键、二硫键、疏水力) 一、蛋白质的一级结构 从多肽链的N端到C端的共价主链及氨基酸的排列顺序。它是蛋白质结构层次体系的基础,是决定更高层次结构的主要因素。 主要因素 (一级结构 ) 高级结构 辅助因素 (分子伴侣) 一、蛋白质的一级结构(多肽) 一个氨基酸的氨基与另一个氨基酸的羧基之间失水形成的酰胺键称为肽键,所形成的化合物称为肽。 在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种排列顺序称为氨基酸顺序 通常在多肽链的一端含有一个游离的?-氨基,称为氨基端或N-端;在另一端含有一个游离的?-羧基,称为羧基端或C-端。 氨基酸的顺序是从N-端的氨基酸残基开始,以C-端氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为: Ser-Val-Tyr-Asp-Gln (二)肽键 肽键的特点是氮原子上的孤对电子与羰基具有明显的共轭作用。 组成肽键的原子处于同一平面。 肽键中的C-N键具有部分双键性质,不能自由旋转。 (三)二硫键 在蛋白质的三维结构中,靠近的两个半胱氨酸(Cys)的巯基(-SH)之间可被氧化形成二硫键。作为一个合成的结构单位成为胱氨酸(Cystine)。 二硫键按以下反应式由空气氧化产生: 2CH2SH+1/2 O2= -CH2-S-S-CH2-+H2O 二硫键的形成需要一个氧化环境,因此二硫键一般不出现在细胞
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