生物芯片技术与分析方法课件.ppt

  1. 1、本文档共90页,可阅读全部内容。
  2. 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 基因表达分析软件 ArrayTools 点击网站下方的“Guest Book”进入注册页面 基因表达分析软件 ArrayTools 采用英语数字格式 基因表达分析软件 ArrayTools 基因表达分析软件 ArrayTools 基因表达分析软件 ArrayTools SAM 基因表达分析软件 ArrayTools 层次聚类 基因表达分析软件 ArrayTools k均值聚类 基因功能数据库 Gene Ontology (GO) Neurod6 神经源性分化因子 基因功能数据库 Gene Ontology (GO) 基因功能数据库 Gene Ontology (GO) 基因功能数据库 Gene Ontology (GO) 基因功能数据库 Gene Ontology (GO) 基因功能数据库 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) PGM1 葡萄糖磷酸变位酶 基因功能数据库 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) 基因功能数据库 基因功能数据库 基因功能数据库 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) Akt2 red Gck red Irs1 red Irs2 red Ppp1r3a red Ptpn1 red Slc2a4 red 基因功能数据库 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) 基因功能分析软件 The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery(DAVID) / 基因功能分析软件 The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery(DAVID) 基因功能分析软件 The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery(DAVID) 基因功能分析软件 The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery(DAVID) 基因功能分析软件 The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery(DAVID) 基因功能分析软件 The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery(DAVID) 小结 基因芯片的类型 基因芯片数据的预处理 差异表达基因的筛选 基于基因芯片数据的聚类方法 基于基因芯片数据的分类方法 基因的功能研究 GEO GO ArrayTools DAVID ArrayExpress KEGG 随堂考核 列举基因芯片的特点 常用的基因功能注释数据库 基于900个患者和100个正常人的基因芯片数据,构建分类器,最终,850个患者和50个正常人被分到了正确的类别,计算分类器效能。 Thank You! * * * * 聚类算法 k均值聚类 优化目标:最小化类内样本两两间的距离之和 六、分类分析 分类目的 构建分类模式对样本类别进行预测 利用已知类别的观察数据构建分类器 利用已构建的分类器对未知样本进行类别预测 常用于疾病的精确预测 在构建分类器的同时,某些方法可用于挖掘疾病相关基因 分类算法 Fisher线性判别 分类算法 k近邻分类法 分类算法 决策树 多级分类器,可以把一个复杂的多类别分类问题转化为若干个简单的分类问题来解决 决策树的结构:树形结构,根节点,内部节点,叶子节点 决策规则 分类算法 决策树 Outlook Humidity Windy Play Sunny 75 False No Sunny 79 True No Overcast 60 False Yes Rainy 55 False Yes Rainy 75 False Yes Rainy 80 True No Overcast 80 True Yes Su

文档评论(0)

带头大哥 + 关注
实名认证
内容提供者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档