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以贝叶斯方法构建系统发育树 谢 强，卜文俊+ (南开大学生命科学学院昆虫学研究所昆虫分子系统学实验室，天津 300071) 摘 要：近年来，应用贝叶斯方法的系统发育研究大量增加，并且已举办过较大范围内的专题性国际学术会议。 与以前最为常用的最大似然和最大简约等方法相比，贝叶斯方法的计算效率相当高。此外，已有的研究结果显 示，对于同一组数据的分析，贝叶斯方法分析结果中的节点支持率高于其它算法中的相应结果。本文简要介绍．了 贝叶斯方法的算法基础、计算流程和算法评价等情况。 关键词：贝叶斯方法；系统发育；马尔科夫链；后验概率 tree method Constructingphylogenetic usingBayesian Xie Qiang，BuWenjun’ (InsectMolecular Lab，Instituteof ofLife Systematics Sciences， Enotomology，College Nankai 300071，China) University，Tianjin Abstract：Recently，thestudies methodhavebeenincreased phylogeneticemployingBayesian very andsome rapidly internationalhave been onthis tOthe congresses performedspecialtopic．Compared likelihood)and MP(maximum havebeenusedmost parsimony)，which before，thecalculationefficiencv popularly of methodis existed show tO Bayesian extremelyhigh．And，thereports thesamenodesinthe that，according phy— resultscarriedoutwithdifferent for logenetic thesame data，the valuesin a— algorithms sequences support Bayesian are thanthoseinthe nalysis othermethods．Thebasic calculationand alwayshigher algorithms，the thee— process valuationof me