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工业微生物功能基因组研究进展.pdf
发酵工程学科的进展
——第四班垒国发酵工程学术讨论套静主粜
工业微生物功能基因组研究进展
林敏
(中国农业科学院生物技术研究所)
目前国际工业生物技术的发展已进人以微生物基因组学和系统生物学为平台,以生
物信息学和基因芯片等技术为支持,以研究和揭示代谢网络为线索,以重要功能基因的
鉴定为重点,通过技术集成对微生物及其生产工艺进行分子设计和定向遗传改造的新阶
段。国际上围绕工业微生物基因组和功能基因组研究展开的竞争日趋激烈。美国能源
to
部启动了“微生物基因组计划”(MGP)和“基因组到生命计划”(GenomeLife),掀起了
微生物基因组研究的新一轮热潮。1996年2个细菌种属首次完成全序列分析。1996年
245种、2006年360种重要微生物完成全基因组序列分析,还有600余种正在研究之中。
截止到目前,已经完成或正在进行全基因组序列测定的工业微生物的数量是病原等其他
微生物的两倍。但是出于经济利益以及垄断技术和市场等方面的考虑,大多数研究机构
和企业对其所获得的工业微生物基因组和功能基因等方面的数据和信息严加保密。几
种重要的工业模式微生物列表如下:
枯草芽孢杆菌是第一个被测序的革兰氏阳性细菌
(1997年),基因组大小为4.2Mbp,编码4105种蛋
白。可代谢多种炭源并分泌大量具有重要工业用途
的酶。
bacteriumofdirect—
嗜热纤维梭菌(anaerobiccapable
cellulosefrombiomassinto
lyconverting ethan01)能
利用纤维素、半纤维素、已糖、戊糖来发酵乙醇。基因
组大小为3.8Mbp,编码3163种蛋白。
ofstarch—based
丙酮丁醇梭菌(Industrial
producer
acetone,butanol,and
ethan01)基因组大小为3.9
Mbp,编码3672种蛋白。可将淀粉转化为有机溶剂
丙酮和丁醇。
林敏:工业微生物功能基因组研究进展
谷氨酸棒状杆菌(Industrialof ami—
producermultiple
noacids)用于工业化生产氨基酸如谷氨酸和其它工
业原料,基因组大小为3.3
Mbp,编码2993种蛋白。
for
大肠杆菌(Modelorganism
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