差异蛋白基因生物信息学在冠心病血瘀证遗传相关验证中的应用.pdfVIP

中国组织工程研究 第 18 卷 第 51 期 2014–12–10 出版 Chinese Journal of Tissue Engineering Research December 10, 2014 Vol.18, No.51 ISSN 2095-4344 CN 21-1581/R CODEN: ZLKHAH 8337 www.CRTER.org 郑景辉，男，1976 年生， 汉族，2010 年湖南中医药 大学毕业，博士，副教授， 主要从事心脑血管疾病的 中西医结合诊疗的研究。 doi:10.3969/j issn.2095-4344. 2014.51.026 [http://www ] 中图分类号:R318 文献标识码:B 文章编号:2095-4344 (2014)51-08337-09 稿件接受：2014-11-28 Zheng Jing-hui, M.D., Associate professor, ICU of Second Hospital Affiliated to Guangzhou University of Chinese Medicine, Guangzhou 510120, Guangdong Province, China Accepted: 2014-11-28 差异蛋白基因生物信息学在冠心病血瘀证遗传相关验证中的应用 郑景辉1，袁肇凯2，张敏州1，李 杰2，王丽萍3，宁桂兰4，孙贵香2，简维雄2，黄献平2，刘吉勇2(1广州中医药大学第二附属医院重症医 学科，广东省广州市 510120；2湖南中医药大学中医诊断研究所，湖南省长沙市 410007；3湖南怀化医学高等专科学校，湖南省怀化 市 418000；4广西中医药大学附属瑞康医院，广西壮族自治区南宁市 530011) 文章亮点： 采用生物信息学分析方法对冠心病血瘀证的差异基因功能、信号转导通路、基因蛋白相互作用进行分析，发 现了差异蛋白基因主要参与 43 种生物学过程、3 种细胞组分、6 种分子途径，差异蛋白主要参与 10 条信号 转导通路，这些蛋白在多条信号转导通路上相互发生作用，发现节点 189 个，路径映射 5 个，节点的功能种 类包括 29 类。 关键词： 组织构建；组织工程；冠心病；血瘀证；遗传；基因组学；生物信息学；国家自然科学基金 主题词： 心脏病；动脉粥样硬化；基因组学 基金资助： 国家自然科学基金青年项目；中国博士后科学基金特别资助项目(2014T70800)；广西自然科学基 金课题(2012GXNSFAA053113)；广西壮族自治区卫生厅中医药科技专项课题(GZPT1219)；广西壮族自治区 卫生厅自筹经费科研课题(Z2012181) 摘要 背景：课题组前期通过临床流行病学和分子流行病学显示冠状动脉粥样硬化性心脏病血瘀证具有一定的家族 聚集倾向，发现其相关的差异基因与炎症、斑块形成及血管内皮损伤密切相关。 目的：对冠心病血瘀证遗传相关的差异蛋白基因进行生物信息学分析。 方法：根据流行病学调查基础上基因芯片技术确定的冠心病血瘀证遗传相关的差异蛋白基因，通过 DAVID 数 据库搜索软件结合 GO 数据库搜索进行注释和富集度分析；KEGG、BIOCARTA、BBIOD 数据库进行信号转 导通路分析；VISANT、DIP 数据库检索蛋白质相互作用。 结果与结论：差异蛋白基因主要参与 43 种生物学过程、3 种细胞组分、6 种分子途径，差异蛋白主要参与 10 条信号转导通路，这些蛋白在多条信号转导通路上相互发生作用，发现节点 189 个，路径映射 5 个，节点的 功能种类包括 29 类。冠心病血瘀证患者遗传差异基因的功能、通路以及相互作用主要体现在炎症反应、免疫 调节、细胞因子趋化、细胞增殖等方面；冠心病血瘀证在多位点、多环节、多种生物学进程中共同发挥作用 的复杂病理反应，基因组学生物信息学技术可以站在“整体观”的角度对中医证候的机制作出预测，结合进 一步分子生物学验证是一条很好的中医药现代化途径。 郑景辉，袁肇凯，张敏州，李杰，王丽萍，宁桂兰，孙贵香，简维雄，黄献平，刘吉勇. 差异蛋白基因生物信 息学在冠心病血瘀证遗传相关验证中的应用[J].中国组织